Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI0

TMEM138, Transmembrane protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM138Q9NPI0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM138Q9NPI0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM138Q9NPI0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM138Q9NPI0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM138Q9NPI0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM138Q9NPI0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM138Q9NPI0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM138Q9NPI0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM138Q9NPI0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM138Q9NPI0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM138Q9NPI0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM138Q9NPI0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM138Q9NPI0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM138Q9NPI0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM138Q9NPI0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM138Q9NPI0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM138Q9NPI0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM138Q9NPI0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM138Q9NPI0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM138Q9NPI0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM138Q9NPI0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM138Q9NPI0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM138Q9NPI0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM138Q9NPI0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM138Q9NPI0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM138Q9NPI0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM138Q9NPI0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM138Q9NPI0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM138Q9NPI0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM138Q9NPI0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM138Q9NPI0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM138Q9NPI0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM138Q9NPI0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM138Q9NPI0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM138Q9NPI0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM138Q9NPI0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM138Q9NPI0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM138Q9NPI0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM138Q9NPI0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM138Q9NPI0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM138Q9NPI0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM138Q9NPI0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM138Q9NPI0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM138Q9NPI0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM138Q9NPI0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM138Q9NPI0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM138Q9NPI0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM138Q9NPI0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM138Q9NPI0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM138Q9NPI0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM138Q9NPI0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM138Q9NPI0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM138Q9NPI0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM138Q9NPI0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM138Q9NPI0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM138Q9NPI0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM138Q9NPI0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM138Q9NPI0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM138Q9NPI0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM138Q9NPI0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM138Q9NPI0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM138Q9NPI0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM138Q9NPI0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM138Q9NPI0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM138Q9NPI0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM138Q9NPI0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM138Q9NPI0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM138Q9NPI0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM138Q9NPI0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM138Q9NPI0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM138Q9NPI0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM138Q9NPI0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM138Q9NPI0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM138Q9NPI0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM138Q9NPI0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM138Q9NPI0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM138Q9NPI0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM138Q9NPI0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM138Q9NPI0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM138Q9NPI0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM138Q9NPI0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM138Q9NPI0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM138Q9NPI0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM138Q9NPI0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM138Q9NPI0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM138Q9NPI0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM138Q9NPI0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM138Q9NPI0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM138Q9NPI0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM138Q9NPI0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM138Q9NPI0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM138Q9NPI0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM138Q9NPI0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM138Q9NPI0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM138Q9NPI0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM138Q9NPI0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM138Q9NPI0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM138Q9NPI0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM138Q9NPI0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM138Q9NPI0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms