Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP84

TNFRSF12A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 12A, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF12AQ9NP84 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFRSF12AQ9NP84 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFRSF12AQ9NP84 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFRSF12AQ9NP84 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFRSF12AQ9NP84 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFRSF12AQ9NP84 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFRSF12AQ9NP84 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFRSF12AQ9NP84 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFRSF12AQ9NP84 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFRSF12AQ9NP84 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFRSF12AQ9NP84 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFRSF12AQ9NP84 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF12AQ9NP84 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF12AQ9NP84 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF12AQ9NP84 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF12AQ9NP84 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF12AQ9NP84 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF12AQ9NP84 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFRSF12AQ9NP84 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFRSF12AQ9NP84 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFRSF12AQ9NP84 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFRSF12AQ9NP84 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFRSF12AQ9NP84 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF12AQ9NP84 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF12AQ9NP84 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF12AQ9NP84 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF12AQ9NP84 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF12AQ9NP84 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF12AQ9NP84 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF12AQ9NP84 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF12AQ9NP84 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFRSF12AQ9NP84 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFRSF12AQ9NP84 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFRSF12AQ9NP84 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFRSF12AQ9NP84 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFRSF12AQ9NP84 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFRSF12AQ9NP84 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFRSF12AQ9NP84 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFRSF12AQ9NP84 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFRSF12AQ9NP84 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFRSF12AQ9NP84 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFRSF12AQ9NP84 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFRSF12AQ9NP84 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFRSF12AQ9NP84 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFRSF12AQ9NP84 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFRSF12AQ9NP84 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFRSF12AQ9NP84 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFRSF12AQ9NP84 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFRSF12AQ9NP84 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFRSF12AQ9NP84 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFRSF12AQ9NP84 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFRSF12AQ9NP84 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFRSF12AQ9NP84 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFRSF12AQ9NP84 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFRSF12AQ9NP84 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFRSF12AQ9NP84 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFRSF12AQ9NP84 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFRSF12AQ9NP84 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFRSF12AQ9NP84 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFRSF12AQ9NP84 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
TNFRSF12AQ9NP84 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF12AQ9NP84 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF12AQ9NP84 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF12AQ9NP84 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF12AQ9NP84 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF12AQ9NP84 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF12AQ9NP84 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF12AQ9NP84 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF12AQ9NP84 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF12AQ9NP84 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF12AQ9NP84 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF12AQ9NP84 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF12AQ9NP84 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF12AQ9NP84 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF12AQ9NP84 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF12AQ9NP84 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF12AQ9NP84 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF12AQ9NP84 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF12AQ9NP84 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF12AQ9NP84 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF12AQ9NP84 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF12AQ9NP84 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF12AQ9NP84 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF12AQ9NP84 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF12AQ9NP84 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF12AQ9NP84 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF12AQ9NP84 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF12AQ9NP84 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFRSF12AQ9NP84 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFRSF12AQ9NP84 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF12AQ9NP84 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF12AQ9NP84 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF12AQ9NP84 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFRSF12AQ9NP84 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFRSF12AQ9NP84 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFRSF12AQ9NP84 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFRSF12AQ9NP84 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFRSF12AQ9NP84 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFRSF12AQ9NP84 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFRSF12AQ9NP84 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms