Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC24A3Q9HC58 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC24A3Q9HC58 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC24A3Q9HC58 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC24A3Q9HC58 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC24A3Q9HC58 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC24A3Q9HC58 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC24A3Q9HC58 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC24A3Q9HC58 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC24A3Q9HC58 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC24A3Q9HC58 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC24A3Q9HC58 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC24A3Q9HC58 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC24A3Q9HC58 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC24A3Q9HC58 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC24A3Q9HC58 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC24A3Q9HC58 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC24A3Q9HC58 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC24A3Q9HC58 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC24A3Q9HC58 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC24A3Q9HC58 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC24A3Q9HC58 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC24A3Q9HC58 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC24A3Q9HC58 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC24A3Q9HC58 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC24A3Q9HC58 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC24A3Q9HC58 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC24A3Q9HC58 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC24A3Q9HC58 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC24A3Q9HC58 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC24A3Q9HC58 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC24A3Q9HC58 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC24A3Q9HC58 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC24A3Q9HC58 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC24A3Q9HC58 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC24A3Q9HC58 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC24A3Q9HC58 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC24A3Q9HC58 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC24A3Q9HC58 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC24A3Q9HC58 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC24A3Q9HC58 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC24A3Q9HC58 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC24A3Q9HC58 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC24A3Q9HC58 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC24A3Q9HC58 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC24A3Q9HC58 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC24A3Q9HC58 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC24A3Q9HC58 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC24A3Q9HC58 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC24A3Q9HC58 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC24A3Q9HC58 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC24A3Q9HC58 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC24A3Q9HC58 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC24A3Q9HC58 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC24A3Q9HC58 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC24A3Q9HC58 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC24A3Q9HC58 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC24A3Q9HC58 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC24A3Q9HC58 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC24A3Q9HC58 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC24A3Q9HC58 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC24A3Q9HC58 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC24A3Q9HC58 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC24A3Q9HC58 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC24A3Q9HC58 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC24A3Q9HC58 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC24A3Q9HC58 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC24A3Q9HC58 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC24A3Q9HC58 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC24A3Q9HC58 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC24A3Q9HC58 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC24A3Q9HC58 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC24A3Q9HC58 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC24A3Q9HC58 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC24A3Q9HC58 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC24A3Q9HC58 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC24A3Q9HC58 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC24A3Q9HC58 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC24A3Q9HC58 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC24A3Q9HC58 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC24A3Q9HC58 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC24A3Q9HC58 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC24A3Q9HC58 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC24A3Q9HC58 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC24A3Q9HC58 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC24A3Q9HC58 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC24A3Q9HC58 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC24A3Q9HC58 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC24A3Q9HC58 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC24A3Q9HC58 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC24A3Q9HC58 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC24A3Q9HC58 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC24A3Q9HC58 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC24A3Q9HC58 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC24A3Q9HC58 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC24A3Q9HC58 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC24A3Q9HC58 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC24A3Q9HC58 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC24A3Q9HC58 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC24A3Q9HC58 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms