Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B9

EPHX3, Epoxide hydrolase 3, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHX3Q9H6B9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EPHX3Q9H6B9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EPHX3Q9H6B9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EPHX3Q9H6B9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EPHX3Q9H6B9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EPHX3Q9H6B9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EPHX3Q9H6B9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EPHX3Q9H6B9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EPHX3Q9H6B9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EPHX3Q9H6B9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
EPHX3Q9H6B9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EPHX3Q9H6B9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EPHX3Q9H6B9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EPHX3Q9H6B9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EPHX3Q9H6B9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EPHX3Q9H6B9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
EPHX3Q9H6B9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EPHX3Q9H6B9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EPHX3Q9H6B9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EPHX3Q9H6B9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EPHX3Q9H6B9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EPHX3Q9H6B9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EPHX3Q9H6B9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EPHX3Q9H6B9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EPHX3Q9H6B9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EPHX3Q9H6B9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EPHX3Q9H6B9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EPHX3Q9H6B9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EPHX3Q9H6B9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EPHX3Q9H6B9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
EPHX3Q9H6B9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EPHX3Q9H6B9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EPHX3Q9H6B9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EPHX3Q9H6B9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EPHX3Q9H6B9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EPHX3Q9H6B9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EPHX3Q9H6B9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EPHX3Q9H6B9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EPHX3Q9H6B9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EPHX3Q9H6B9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
EPHX3Q9H6B9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EPHX3Q9H6B9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EPHX3Q9H6B9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EPHX3Q9H6B9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
EPHX3Q9H6B9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EPHX3Q9H6B9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EPHX3Q9H6B9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EPHX3Q9H6B9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EPHX3Q9H6B9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EPHX3Q9H6B9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EPHX3Q9H6B9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
EPHX3Q9H6B9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
EPHX3Q9H6B9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EPHX3Q9H6B9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EPHX3Q9H6B9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EPHX3Q9H6B9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EPHX3Q9H6B9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EPHX3Q9H6B9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EPHX3Q9H6B9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EPHX3Q9H6B9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EPHX3Q9H6B9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EPHX3Q9H6B9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EPHX3Q9H6B9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EPHX3Q9H6B9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EPHX3Q9H6B9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EPHX3Q9H6B9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EPHX3Q9H6B9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EPHX3Q9H6B9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EPHX3Q9H6B9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EPHX3Q9H6B9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EPHX3Q9H6B9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EPHX3Q9H6B9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EPHX3Q9H6B9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
EPHX3Q9H6B9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EPHX3Q9H6B9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EPHX3Q9H6B9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EPHX3Q9H6B9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EPHX3Q9H6B9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EPHX3Q9H6B9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EPHX3Q9H6B9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EPHX3Q9H6B9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EPHX3Q9H6B9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EPHX3Q9H6B9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EPHX3Q9H6B9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EPHX3Q9H6B9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EPHX3Q9H6B9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EPHX3Q9H6B9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EPHX3Q9H6B9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EPHX3Q9H6B9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EPHX3Q9H6B9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EPHX3Q9H6B9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EPHX3Q9H6B9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EPHX3Q9H6B9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EPHX3Q9H6B9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EPHX3Q9H6B9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
EPHX3Q9H6B9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EPHX3Q9H6B9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EPHX3Q9H6B9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EPHX3Q9H6B9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
EPHX3Q9H6B9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms