Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4X1

RGCC, Regulator of cell cycle RGCC, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGCCQ9H4X1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGCCQ9H4X1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGCCQ9H4X1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RGCCQ9H4X1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGCCQ9H4X1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RGCCQ9H4X1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGCCQ9H4X1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGCCQ9H4X1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGCCQ9H4X1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGCCQ9H4X1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGCCQ9H4X1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGCCQ9H4X1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGCCQ9H4X1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGCCQ9H4X1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGCCQ9H4X1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGCCQ9H4X1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGCCQ9H4X1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGCCQ9H4X1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGCCQ9H4X1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGCCQ9H4X1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGCCQ9H4X1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RGCCQ9H4X1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGCCQ9H4X1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGCCQ9H4X1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGCCQ9H4X1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGCCQ9H4X1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGCCQ9H4X1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGCCQ9H4X1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGCCQ9H4X1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGCCQ9H4X1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGCCQ9H4X1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGCCQ9H4X1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGCCQ9H4X1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGCCQ9H4X1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGCCQ9H4X1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGCCQ9H4X1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGCCQ9H4X1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGCCQ9H4X1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGCCQ9H4X1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGCCQ9H4X1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGCCQ9H4X1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RGCCQ9H4X1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGCCQ9H4X1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGCCQ9H4X1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGCCQ9H4X1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGCCQ9H4X1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGCCQ9H4X1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGCCQ9H4X1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RGCCQ9H4X1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RGCCQ9H4X1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGCCQ9H4X1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGCCQ9H4X1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGCCQ9H4X1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGCCQ9H4X1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGCCQ9H4X1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGCCQ9H4X1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RGCCQ9H4X1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGCCQ9H4X1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGCCQ9H4X1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RGCCQ9H4X1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RGCCQ9H4X1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGCCQ9H4X1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGCCQ9H4X1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGCCQ9H4X1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGCCQ9H4X1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGCCQ9H4X1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGCCQ9H4X1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGCCQ9H4X1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGCCQ9H4X1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGCCQ9H4X1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGCCQ9H4X1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGCCQ9H4X1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGCCQ9H4X1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGCCQ9H4X1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGCCQ9H4X1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGCCQ9H4X1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RGCCQ9H4X1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGCCQ9H4X1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGCCQ9H4X1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RGCCQ9H4X1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGCCQ9H4X1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGCCQ9H4X1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGCCQ9H4X1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGCCQ9H4X1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGCCQ9H4X1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGCCQ9H4X1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGCCQ9H4X1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGCCQ9H4X1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGCCQ9H4X1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGCCQ9H4X1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGCCQ9H4X1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGCCQ9H4X1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGCCQ9H4X1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGCCQ9H4X1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGCCQ9H4X1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGCCQ9H4X1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGCCQ9H4X1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGCCQ9H4X1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGCCQ9H4X1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGCCQ9H4X1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms