Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TNMDQ9H2S6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TNMDQ9H2S6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNMDQ9H2S6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNMDQ9H2S6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNMDQ9H2S6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNMDQ9H2S6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TNMDQ9H2S6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNMDQ9H2S6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNMDQ9H2S6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNMDQ9H2S6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNMDQ9H2S6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNMDQ9H2S6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNMDQ9H2S6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNMDQ9H2S6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNMDQ9H2S6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNMDQ9H2S6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNMDQ9H2S6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNMDQ9H2S6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNMDQ9H2S6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNMDQ9H2S6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNMDQ9H2S6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNMDQ9H2S6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNMDQ9H2S6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNMDQ9H2S6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNMDQ9H2S6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNMDQ9H2S6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
TNMDQ9H2S6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNMDQ9H2S6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNMDQ9H2S6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNMDQ9H2S6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNMDQ9H2S6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNMDQ9H2S6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNMDQ9H2S6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNMDQ9H2S6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNMDQ9H2S6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNMDQ9H2S6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNMDQ9H2S6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNMDQ9H2S6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
TNMDQ9H2S6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNMDQ9H2S6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TNMDQ9H2S6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TNMDQ9H2S6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNMDQ9H2S6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNMDQ9H2S6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNMDQ9H2S6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNMDQ9H2S6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNMDQ9H2S6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNMDQ9H2S6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNMDQ9H2S6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNMDQ9H2S6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNMDQ9H2S6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNMDQ9H2S6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNMDQ9H2S6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNMDQ9H2S6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNMDQ9H2S6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNMDQ9H2S6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TNMDQ9H2S6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TNMDQ9H2S6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNMDQ9H2S6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNMDQ9H2S6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNMDQ9H2S6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNMDQ9H2S6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNMDQ9H2S6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNMDQ9H2S6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNMDQ9H2S6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNMDQ9H2S6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TNMDQ9H2S6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNMDQ9H2S6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNMDQ9H2S6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNMDQ9H2S6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNMDQ9H2S6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNMDQ9H2S6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNMDQ9H2S6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNMDQ9H2S6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNMDQ9H2S6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNMDQ9H2S6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNMDQ9H2S6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNMDQ9H2S6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNMDQ9H2S6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNMDQ9H2S6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNMDQ9H2S6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNMDQ9H2S6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNMDQ9H2S6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNMDQ9H2S6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNMDQ9H2S6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNMDQ9H2S6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNMDQ9H2S6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNMDQ9H2S6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNMDQ9H2S6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNMDQ9H2S6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNMDQ9H2S6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNMDQ9H2S6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNMDQ9H2S6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNMDQ9H2S6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNMDQ9H2S6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNMDQ9H2S6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TNMDQ9H2S6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNMDQ9H2S6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNMDQ9H2S6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms