Protein–RNA interactions for Protein: Q9H269

VPS16, Vacuolar protein sorting-associated protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS16Q9H269 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
VPS16Q9H269 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VPS16Q9H269 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
VPS16Q9H269 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
VPS16Q9H269 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
VPS16Q9H269 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
VPS16Q9H269 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
VPS16Q9H269 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
VPS16Q9H269 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VPS16Q9H269 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VPS16Q9H269 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VPS16Q9H269 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VPS16Q9H269 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VPS16Q9H269 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
VPS16Q9H269 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
VPS16Q9H269 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
VPS16Q9H269 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
VPS16Q9H269 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
VPS16Q9H269 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
VPS16Q9H269 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VPS16Q9H269 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VPS16Q9H269 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VPS16Q9H269 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
VPS16Q9H269 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
VPS16Q9H269 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VPS16Q9H269 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VPS16Q9H269 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VPS16Q9H269 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VPS16Q9H269 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VPS16Q9H269 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
VPS16Q9H269 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VPS16Q9H269 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
VPS16Q9H269 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VPS16Q9H269 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VPS16Q9H269 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
VPS16Q9H269 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VPS16Q9H269 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VPS16Q9H269 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VPS16Q9H269 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VPS16Q9H269 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VPS16Q9H269 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VPS16Q9H269 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VPS16Q9H269 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VPS16Q9H269 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VPS16Q9H269 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VPS16Q9H269 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VPS16Q9H269 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
VPS16Q9H269 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VPS16Q9H269 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VPS16Q9H269 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VPS16Q9H269 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VPS16Q9H269 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VPS16Q9H269 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VPS16Q9H269 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VPS16Q9H269 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VPS16Q9H269 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VPS16Q9H269 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VPS16Q9H269 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VPS16Q9H269 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VPS16Q9H269 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VPS16Q9H269 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VPS16Q9H269 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VPS16Q9H269 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VPS16Q9H269 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VPS16Q9H269 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
VPS16Q9H269 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VPS16Q9H269 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VPS16Q9H269 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VPS16Q9H269 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VPS16Q9H269 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
VPS16Q9H269 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
VPS16Q9H269 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
VPS16Q9H269 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
VPS16Q9H269 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
VPS16Q9H269 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VPS16Q9H269 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VPS16Q9H269 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VPS16Q9H269 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VPS16Q9H269 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VPS16Q9H269 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VPS16Q9H269 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VPS16Q9H269 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VPS16Q9H269 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VPS16Q9H269 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VPS16Q9H269 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VPS16Q9H269 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VPS16Q9H269 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VPS16Q9H269 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VPS16Q9H269 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VPS16Q9H269 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VPS16Q9H269 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VPS16Q9H269 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
VPS16Q9H269 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VPS16Q9H269 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VPS16Q9H269 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
VPS16Q9H269 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
VPS16Q9H269 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
VPS16Q9H269 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VPS16Q9H269 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VPS16Q9H269 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms