Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0M0

WWP1, NEDD4-like E3 ubiquitin-protein ligase WWP1, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WWP1Q9H0M0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
WWP1Q9H0M0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
WWP1Q9H0M0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
WWP1Q9H0M0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
WWP1Q9H0M0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
WWP1Q9H0M0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
WWP1Q9H0M0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
WWP1Q9H0M0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
WWP1Q9H0M0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
WWP1Q9H0M0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
WWP1Q9H0M0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
WWP1Q9H0M0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
WWP1Q9H0M0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
WWP1Q9H0M0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
WWP1Q9H0M0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
WWP1Q9H0M0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
WWP1Q9H0M0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
WWP1Q9H0M0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
WWP1Q9H0M0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
WWP1Q9H0M0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
WWP1Q9H0M0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
WWP1Q9H0M0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
WWP1Q9H0M0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
WWP1Q9H0M0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26■■□□□ 1.75
WWP1Q9H0M0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
WWP1Q9H0M0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
WWP1Q9H0M0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
WWP1Q9H0M0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
WWP1Q9H0M0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
WWP1Q9H0M0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
WWP1Q9H0M0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
WWP1Q9H0M0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
WWP1Q9H0M0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
WWP1Q9H0M0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
WWP1Q9H0M0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
WWP1Q9H0M0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
WWP1Q9H0M0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
WWP1Q9H0M0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
WWP1Q9H0M0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
WWP1Q9H0M0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
WWP1Q9H0M0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
WWP1Q9H0M0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
WWP1Q9H0M0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
WWP1Q9H0M0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
WWP1Q9H0M0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
WWP1Q9H0M0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
WWP1Q9H0M0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
WWP1Q9H0M0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
WWP1Q9H0M0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
WWP1Q9H0M0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
WWP1Q9H0M0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
WWP1Q9H0M0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
WWP1Q9H0M0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
WWP1Q9H0M0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
WWP1Q9H0M0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
WWP1Q9H0M0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
WWP1Q9H0M0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
WWP1Q9H0M0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
WWP1Q9H0M0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
WWP1Q9H0M0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
WWP1Q9H0M0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
WWP1Q9H0M0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
WWP1Q9H0M0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
WWP1Q9H0M0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
WWP1Q9H0M0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
WWP1Q9H0M0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
WWP1Q9H0M0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
WWP1Q9H0M0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
WWP1Q9H0M0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
WWP1Q9H0M0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
WWP1Q9H0M0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
WWP1Q9H0M0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
WWP1Q9H0M0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
WWP1Q9H0M0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
WWP1Q9H0M0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
WWP1Q9H0M0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
WWP1Q9H0M0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
WWP1Q9H0M0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
WWP1Q9H0M0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
WWP1Q9H0M0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
WWP1Q9H0M0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
WWP1Q9H0M0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
WWP1Q9H0M0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
WWP1Q9H0M0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WWP1Q9H0M0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
WWP1Q9H0M0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WWP1Q9H0M0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WWP1Q9H0M0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
WWP1Q9H0M0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
WWP1Q9H0M0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
WWP1Q9H0M0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
WWP1Q9H0M0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
WWP1Q9H0M0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
WWP1Q9H0M0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
WWP1Q9H0M0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
WWP1Q9H0M0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
WWP1Q9H0M0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
WWP1Q9H0M0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
WWP1Q9H0M0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
WWP1Q9H0M0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms