Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0H3

KLHL25, Kelch-like protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL25Q9H0H3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL25Q9H0H3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL25Q9H0H3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL25Q9H0H3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL25Q9H0H3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL25Q9H0H3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL25Q9H0H3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL25Q9H0H3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL25Q9H0H3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL25Q9H0H3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHL25Q9H0H3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL25Q9H0H3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL25Q9H0H3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL25Q9H0H3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL25Q9H0H3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL25Q9H0H3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL25Q9H0H3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL25Q9H0H3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL25Q9H0H3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL25Q9H0H3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL25Q9H0H3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL25Q9H0H3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL25Q9H0H3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL25Q9H0H3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL25Q9H0H3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL25Q9H0H3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL25Q9H0H3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL25Q9H0H3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL25Q9H0H3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL25Q9H0H3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KLHL25Q9H0H3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
KLHL25Q9H0H3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL25Q9H0H3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL25Q9H0H3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL25Q9H0H3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL25Q9H0H3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL25Q9H0H3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL25Q9H0H3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL25Q9H0H3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL25Q9H0H3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL25Q9H0H3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL25Q9H0H3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL25Q9H0H3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL25Q9H0H3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL25Q9H0H3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL25Q9H0H3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL25Q9H0H3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL25Q9H0H3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL25Q9H0H3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL25Q9H0H3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL25Q9H0H3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL25Q9H0H3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL25Q9H0H3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL25Q9H0H3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KLHL25Q9H0H3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL25Q9H0H3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL25Q9H0H3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL25Q9H0H3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL25Q9H0H3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL25Q9H0H3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL25Q9H0H3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL25Q9H0H3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL25Q9H0H3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL25Q9H0H3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL25Q9H0H3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KLHL25Q9H0H3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL25Q9H0H3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL25Q9H0H3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL25Q9H0H3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL25Q9H0H3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL25Q9H0H3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL25Q9H0H3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL25Q9H0H3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL25Q9H0H3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL25Q9H0H3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL25Q9H0H3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL25Q9H0H3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL25Q9H0H3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL25Q9H0H3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL25Q9H0H3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL25Q9H0H3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL25Q9H0H3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL25Q9H0H3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL25Q9H0H3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL25Q9H0H3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL25Q9H0H3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL25Q9H0H3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL25Q9H0H3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL25Q9H0H3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL25Q9H0H3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHL25Q9H0H3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHL25Q9H0H3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KLHL25Q9H0H3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KLHL25Q9H0H3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL25Q9H0H3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL25Q9H0H3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL25Q9H0H3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL25Q9H0H3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL25Q9H0H3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL25Q9H0H3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms