Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE4

GTPBP4, Nucleolar GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4Q9BZE4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GTPBP4Q9BZE4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GTPBP4Q9BZE4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GTPBP4Q9BZE4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
GTPBP4Q9BZE4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTPBP4Q9BZE4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTPBP4Q9BZE4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GTPBP4Q9BZE4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GTPBP4Q9BZE4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GTPBP4Q9BZE4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GTPBP4Q9BZE4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
GTPBP4Q9BZE4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GTPBP4Q9BZE4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GTPBP4Q9BZE4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GTPBP4Q9BZE4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GTPBP4Q9BZE4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GTPBP4Q9BZE4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GTPBP4Q9BZE4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GTPBP4Q9BZE4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GTPBP4Q9BZE4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GTPBP4Q9BZE4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GTPBP4Q9BZE4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GTPBP4Q9BZE4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GTPBP4Q9BZE4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GTPBP4Q9BZE4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GTPBP4Q9BZE4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GTPBP4Q9BZE4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GTPBP4Q9BZE4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GTPBP4Q9BZE4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GTPBP4Q9BZE4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GTPBP4Q9BZE4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GTPBP4Q9BZE4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GTPBP4Q9BZE4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GTPBP4Q9BZE4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
GTPBP4Q9BZE4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GTPBP4Q9BZE4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GTPBP4Q9BZE4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GTPBP4Q9BZE4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GTPBP4Q9BZE4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GTPBP4Q9BZE4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GTPBP4Q9BZE4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GTPBP4Q9BZE4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GTPBP4Q9BZE4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GTPBP4Q9BZE4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GTPBP4Q9BZE4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GTPBP4Q9BZE4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GTPBP4Q9BZE4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
GTPBP4Q9BZE4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GTPBP4Q9BZE4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GTPBP4Q9BZE4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GTPBP4Q9BZE4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GTPBP4Q9BZE4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GTPBP4Q9BZE4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GTPBP4Q9BZE4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GTPBP4Q9BZE4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GTPBP4Q9BZE4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GTPBP4Q9BZE4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GTPBP4Q9BZE4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GTPBP4Q9BZE4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GTPBP4Q9BZE4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GTPBP4Q9BZE4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GTPBP4Q9BZE4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GTPBP4Q9BZE4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
GTPBP4Q9BZE4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GTPBP4Q9BZE4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GTPBP4Q9BZE4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GTPBP4Q9BZE4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GTPBP4Q9BZE4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
GTPBP4Q9BZE4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
GTPBP4Q9BZE4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GTPBP4Q9BZE4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GTPBP4Q9BZE4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GTPBP4Q9BZE4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GTPBP4Q9BZE4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GTPBP4Q9BZE4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GTPBP4Q9BZE4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GTPBP4Q9BZE4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GTPBP4Q9BZE4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GTPBP4Q9BZE4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GTPBP4Q9BZE4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GTPBP4Q9BZE4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GTPBP4Q9BZE4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
GTPBP4Q9BZE4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GTPBP4Q9BZE4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
GTPBP4Q9BZE4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
GTPBP4Q9BZE4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GTPBP4Q9BZE4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GTPBP4Q9BZE4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GTPBP4Q9BZE4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GTPBP4Q9BZE4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GTPBP4Q9BZE4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GTPBP4Q9BZE4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GTPBP4Q9BZE4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GTPBP4Q9BZE4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GTPBP4Q9BZE4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GTPBP4Q9BZE4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GTPBP4Q9BZE4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GTPBP4Q9BZE4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GTPBP4Q9BZE4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GTPBP4Q9BZE4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms