Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
FANCD2Q9BXW9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
FANCD2Q9BXW9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
FANCD2Q9BXW9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
FANCD2Q9BXW9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC45.6■■■■■ 4.89
FANCD2Q9BXW9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
FANCD2Q9BXW9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
FANCD2Q9BXW9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC45.58■■■■■ 4.89
FANCD2Q9BXW9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.58■■■■■ 4.89
FANCD2Q9BXW9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC45.57■■■■■ 4.89
FANCD2Q9BXW9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
FANCD2Q9BXW9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
FANCD2Q9BXW9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC45.56■■■■■ 4.88
FANCD2Q9BXW9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
FANCD2Q9BXW9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.55■■■■■ 4.88
FANCD2Q9BXW9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
FANCD2Q9BXW9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
FANCD2Q9BXW9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
FANCD2Q9BXW9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.53■■■■■ 4.88
FANCD2Q9BXW9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC45.53■■■■■ 4.88
FANCD2Q9BXW9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC45.53■■■■■ 4.88
FANCD2Q9BXW9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC45.51■■■■■ 4.88
FANCD2Q9BXW9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC45.51■■■■■ 4.88
FANCD2Q9BXW9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
FANCD2Q9BXW9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
FANCD2Q9BXW9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
FANCD2Q9BXW9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC45.49■■■■■ 4.87
FANCD2Q9BXW9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC45.46■■■■■ 4.87
FANCD2Q9BXW9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.45■■■■■ 4.87
FANCD2Q9BXW9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
FANCD2Q9BXW9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC45.44■■■■■ 4.87
FANCD2Q9BXW9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC45.44■■■■■ 4.87
FANCD2Q9BXW9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC45.44■■■■■ 4.86
FANCD2Q9BXW9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.44■■■■■ 4.86
FANCD2Q9BXW9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC45.43■■■■■ 4.86
FANCD2Q9BXW9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
FANCD2Q9BXW9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC45.41■■■■■ 4.86
FANCD2Q9BXW9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.41■■■■■ 4.86
FANCD2Q9BXW9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC45.4■■■■■ 4.86
FANCD2Q9BXW9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC45.39■■■■■ 4.86
FANCD2Q9BXW9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
FANCD2Q9BXW9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.85
FANCD2Q9BXW9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
FANCD2Q9BXW9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
FANCD2Q9BXW9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC45.35■■■■■ 4.85
FANCD2Q9BXW9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC45.33■■■■■ 4.85
FANCD2Q9BXW9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC45.32■■■■■ 4.85
FANCD2Q9BXW9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
FANCD2Q9BXW9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
FANCD2Q9BXW9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
FANCD2Q9BXW9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC45.29■■■■■ 4.84
FANCD2Q9BXW9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
FANCD2Q9BXW9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
FANCD2Q9BXW9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
FANCD2Q9BXW9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC45.27■■■■■ 4.84
FANCD2Q9BXW9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
FANCD2Q9BXW9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
FANCD2Q9BXW9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
FANCD2Q9BXW9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC45.24■■■■■ 4.83
FANCD2Q9BXW9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC45.23■■■■■ 4.83
FANCD2Q9BXW9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC45.23■■■■■ 4.83
FANCD2Q9BXW9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC45.22■■■■■ 4.83
FANCD2Q9BXW9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.22■■■■■ 4.83
FANCD2Q9BXW9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
FANCD2Q9BXW9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
FANCD2Q9BXW9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC45.21■■■■■ 4.83
FANCD2Q9BXW9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
FANCD2Q9BXW9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
FANCD2Q9BXW9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
FANCD2Q9BXW9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
FANCD2Q9BXW9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
FANCD2Q9BXW9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC45.2■■■■■ 4.83
FANCD2Q9BXW9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
FANCD2Q9BXW9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
FANCD2Q9BXW9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
FANCD2Q9BXW9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC45.18■■■■■ 4.82
FANCD2Q9BXW9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
FANCD2Q9BXW9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.18■■■■■ 4.82
FANCD2Q9BXW9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC45.17■■■■■ 4.82
FANCD2Q9BXW9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC45.17■■■■■ 4.82
FANCD2Q9BXW9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
FANCD2Q9BXW9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC45.17■■■■■ 4.82
FANCD2Q9BXW9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
FANCD2Q9BXW9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC45.16■■■■■ 4.82
FANCD2Q9BXW9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC45.15■■■■■ 4.82
FANCD2Q9BXW9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
FANCD2Q9BXW9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC45.14■■■■■ 4.82
FANCD2Q9BXW9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC45.14■■■■■ 4.82
FANCD2Q9BXW9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC45.13■■■■■ 4.82
FANCD2Q9BXW9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.13■■■■■ 4.82
FANCD2Q9BXW9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.81
FANCD2Q9BXW9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
FANCD2Q9BXW9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.11■■■■■ 4.81
FANCD2Q9BXW9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
FANCD2Q9BXW9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
FANCD2Q9BXW9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
FANCD2Q9BXW9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
FANCD2Q9BXW9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC45.09■■■■■ 4.81
FANCD2Q9BXW9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC45.08■■■■■ 4.81
FANCD2Q9BXW9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.08■■■■■ 4.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms