Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms