Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUE0

MED18, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 18, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED18Q9BUE0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MED18Q9BUE0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED18Q9BUE0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED18Q9BUE0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED18Q9BUE0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED18Q9BUE0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED18Q9BUE0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED18Q9BUE0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED18Q9BUE0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED18Q9BUE0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED18Q9BUE0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED18Q9BUE0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED18Q9BUE0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED18Q9BUE0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED18Q9BUE0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED18Q9BUE0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED18Q9BUE0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED18Q9BUE0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED18Q9BUE0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED18Q9BUE0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED18Q9BUE0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED18Q9BUE0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED18Q9BUE0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED18Q9BUE0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED18Q9BUE0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED18Q9BUE0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED18Q9BUE0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED18Q9BUE0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED18Q9BUE0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED18Q9BUE0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED18Q9BUE0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED18Q9BUE0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED18Q9BUE0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED18Q9BUE0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED18Q9BUE0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED18Q9BUE0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED18Q9BUE0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED18Q9BUE0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED18Q9BUE0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED18Q9BUE0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED18Q9BUE0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED18Q9BUE0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED18Q9BUE0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MED18Q9BUE0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MED18Q9BUE0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MED18Q9BUE0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MED18Q9BUE0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MED18Q9BUE0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MED18Q9BUE0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MED18Q9BUE0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MED18Q9BUE0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MED18Q9BUE0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MED18Q9BUE0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MED18Q9BUE0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MED18Q9BUE0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MED18Q9BUE0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MED18Q9BUE0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MED18Q9BUE0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MED18Q9BUE0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MED18Q9BUE0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MED18Q9BUE0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MED18Q9BUE0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MED18Q9BUE0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MED18Q9BUE0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MED18Q9BUE0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED18Q9BUE0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED18Q9BUE0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED18Q9BUE0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED18Q9BUE0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MED18Q9BUE0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED18Q9BUE0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED18Q9BUE0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED18Q9BUE0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED18Q9BUE0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED18Q9BUE0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED18Q9BUE0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED18Q9BUE0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED18Q9BUE0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED18Q9BUE0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED18Q9BUE0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED18Q9BUE0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MED18Q9BUE0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MED18Q9BUE0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED18Q9BUE0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED18Q9BUE0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED18Q9BUE0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED18Q9BUE0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED18Q9BUE0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED18Q9BUE0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED18Q9BUE0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED18Q9BUE0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED18Q9BUE0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED18Q9BUE0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED18Q9BUE0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED18Q9BUE0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED18Q9BUE0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MED18Q9BUE0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED18Q9BUE0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED18Q9BUE0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED18Q9BUE0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms