Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM43Q9BTV4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM43Q9BTV4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM43Q9BTV4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM43Q9BTV4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM43Q9BTV4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM43Q9BTV4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM43Q9BTV4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM43Q9BTV4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM43Q9BTV4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM43Q9BTV4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM43Q9BTV4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM43Q9BTV4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM43Q9BTV4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM43Q9BTV4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM43Q9BTV4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM43Q9BTV4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM43Q9BTV4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM43Q9BTV4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM43Q9BTV4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM43Q9BTV4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM43Q9BTV4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM43Q9BTV4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM43Q9BTV4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM43Q9BTV4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM43Q9BTV4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM43Q9BTV4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM43Q9BTV4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM43Q9BTV4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM43Q9BTV4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM43Q9BTV4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM43Q9BTV4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM43Q9BTV4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM43Q9BTV4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM43Q9BTV4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM43Q9BTV4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM43Q9BTV4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM43Q9BTV4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM43Q9BTV4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM43Q9BTV4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM43Q9BTV4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM43Q9BTV4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM43Q9BTV4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM43Q9BTV4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM43Q9BTV4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM43Q9BTV4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM43Q9BTV4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM43Q9BTV4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM43Q9BTV4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM43Q9BTV4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM43Q9BTV4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM43Q9BTV4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM43Q9BTV4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM43Q9BTV4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM43Q9BTV4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM43Q9BTV4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM43Q9BTV4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM43Q9BTV4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM43Q9BTV4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM43Q9BTV4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM43Q9BTV4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM43Q9BTV4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM43Q9BTV4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM43Q9BTV4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM43Q9BTV4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM43Q9BTV4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM43Q9BTV4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM43Q9BTV4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM43Q9BTV4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM43Q9BTV4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM43Q9BTV4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM43Q9BTV4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM43Q9BTV4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM43Q9BTV4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM43Q9BTV4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM43Q9BTV4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM43Q9BTV4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM43Q9BTV4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM43Q9BTV4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM43Q9BTV4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM43Q9BTV4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM43Q9BTV4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM43Q9BTV4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM43Q9BTV4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM43Q9BTV4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM43Q9BTV4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM43Q9BTV4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM43Q9BTV4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM43Q9BTV4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM43Q9BTV4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM43Q9BTV4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM43Q9BTV4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM43Q9BTV4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM43Q9BTV4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM43Q9BTV4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM43Q9BTV4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM43Q9BTV4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM43Q9BTV4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM43Q9BTV4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM43Q9BTV4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms