Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTN0

LRFN3, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN3Q9BTN0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LRFN3Q9BTN0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LRFN3Q9BTN0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRFN3Q9BTN0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRFN3Q9BTN0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRFN3Q9BTN0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
LRFN3Q9BTN0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRFN3Q9BTN0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRFN3Q9BTN0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRFN3Q9BTN0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRFN3Q9BTN0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRFN3Q9BTN0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRFN3Q9BTN0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRFN3Q9BTN0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRFN3Q9BTN0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRFN3Q9BTN0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LRFN3Q9BTN0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRFN3Q9BTN0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRFN3Q9BTN0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRFN3Q9BTN0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRFN3Q9BTN0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRFN3Q9BTN0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRFN3Q9BTN0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRFN3Q9BTN0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRFN3Q9BTN0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRFN3Q9BTN0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRFN3Q9BTN0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRFN3Q9BTN0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRFN3Q9BTN0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRFN3Q9BTN0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRFN3Q9BTN0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRFN3Q9BTN0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRFN3Q9BTN0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRFN3Q9BTN0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRFN3Q9BTN0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRFN3Q9BTN0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRFN3Q9BTN0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRFN3Q9BTN0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRFN3Q9BTN0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LRFN3Q9BTN0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRFN3Q9BTN0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRFN3Q9BTN0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
LRFN3Q9BTN0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRFN3Q9BTN0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LRFN3Q9BTN0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRFN3Q9BTN0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRFN3Q9BTN0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRFN3Q9BTN0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRFN3Q9BTN0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRFN3Q9BTN0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRFN3Q9BTN0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRFN3Q9BTN0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRFN3Q9BTN0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRFN3Q9BTN0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRFN3Q9BTN0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRFN3Q9BTN0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRFN3Q9BTN0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRFN3Q9BTN0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRFN3Q9BTN0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRFN3Q9BTN0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRFN3Q9BTN0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRFN3Q9BTN0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
LRFN3Q9BTN0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRFN3Q9BTN0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRFN3Q9BTN0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRFN3Q9BTN0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRFN3Q9BTN0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRFN3Q9BTN0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRFN3Q9BTN0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRFN3Q9BTN0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LRFN3Q9BTN0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRFN3Q9BTN0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRFN3Q9BTN0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRFN3Q9BTN0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRFN3Q9BTN0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRFN3Q9BTN0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRFN3Q9BTN0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRFN3Q9BTN0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LRFN3Q9BTN0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRFN3Q9BTN0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRFN3Q9BTN0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRFN3Q9BTN0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRFN3Q9BTN0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRFN3Q9BTN0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRFN3Q9BTN0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRFN3Q9BTN0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRFN3Q9BTN0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRFN3Q9BTN0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LRFN3Q9BTN0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRFN3Q9BTN0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRFN3Q9BTN0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRFN3Q9BTN0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LRFN3Q9BTN0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRFN3Q9BTN0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRFN3Q9BTN0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRFN3Q9BTN0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LRFN3Q9BTN0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRFN3Q9BTN0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRFN3Q9BTN0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRFN3Q9BTN0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms