Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PAGR1Q9BTK6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PAGR1Q9BTK6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PAGR1Q9BTK6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PAGR1Q9BTK6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PAGR1Q9BTK6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PAGR1Q9BTK6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PAGR1Q9BTK6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PAGR1Q9BTK6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PAGR1Q9BTK6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PAGR1Q9BTK6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PAGR1Q9BTK6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PAGR1Q9BTK6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PAGR1Q9BTK6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PAGR1Q9BTK6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PAGR1Q9BTK6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PAGR1Q9BTK6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PAGR1Q9BTK6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PAGR1Q9BTK6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PAGR1Q9BTK6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
PAGR1Q9BTK6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PAGR1Q9BTK6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PAGR1Q9BTK6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PAGR1Q9BTK6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PAGR1Q9BTK6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
PAGR1Q9BTK6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PAGR1Q9BTK6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PAGR1Q9BTK6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PAGR1Q9BTK6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PAGR1Q9BTK6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PAGR1Q9BTK6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PAGR1Q9BTK6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PAGR1Q9BTK6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PAGR1Q9BTK6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PAGR1Q9BTK6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PAGR1Q9BTK6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PAGR1Q9BTK6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PAGR1Q9BTK6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PAGR1Q9BTK6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PAGR1Q9BTK6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PAGR1Q9BTK6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PAGR1Q9BTK6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PAGR1Q9BTK6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PAGR1Q9BTK6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PAGR1Q9BTK6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PAGR1Q9BTK6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PAGR1Q9BTK6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
PAGR1Q9BTK6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PAGR1Q9BTK6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PAGR1Q9BTK6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PAGR1Q9BTK6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PAGR1Q9BTK6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PAGR1Q9BTK6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PAGR1Q9BTK6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PAGR1Q9BTK6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PAGR1Q9BTK6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PAGR1Q9BTK6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PAGR1Q9BTK6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PAGR1Q9BTK6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PAGR1Q9BTK6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PAGR1Q9BTK6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PAGR1Q9BTK6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PAGR1Q9BTK6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PAGR1Q9BTK6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PAGR1Q9BTK6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PAGR1Q9BTK6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PAGR1Q9BTK6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PAGR1Q9BTK6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PAGR1Q9BTK6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PAGR1Q9BTK6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PAGR1Q9BTK6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
PAGR1Q9BTK6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PAGR1Q9BTK6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PAGR1Q9BTK6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PAGR1Q9BTK6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
PAGR1Q9BTK6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PAGR1Q9BTK6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PAGR1Q9BTK6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PAGR1Q9BTK6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PAGR1Q9BTK6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PAGR1Q9BTK6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PAGR1Q9BTK6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PAGR1Q9BTK6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PAGR1Q9BTK6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PAGR1Q9BTK6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PAGR1Q9BTK6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PAGR1Q9BTK6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PAGR1Q9BTK6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PAGR1Q9BTK6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PAGR1Q9BTK6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PAGR1Q9BTK6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PAGR1Q9BTK6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
PAGR1Q9BTK6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PAGR1Q9BTK6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PAGR1Q9BTK6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PAGR1Q9BTK6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PAGR1Q9BTK6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PAGR1Q9BTK6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PAGR1Q9BTK6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PAGR1Q9BTK6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms