Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RBM42Q9BTD8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RBM42Q9BTD8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RBM42Q9BTD8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RBM42Q9BTD8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RBM42Q9BTD8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RBM42Q9BTD8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RBM42Q9BTD8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RBM42Q9BTD8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RBM42Q9BTD8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RBM42Q9BTD8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RBM42Q9BTD8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RBM42Q9BTD8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RBM42Q9BTD8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
RBM42Q9BTD8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RBM42Q9BTD8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
RBM42Q9BTD8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RBM42Q9BTD8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RBM42Q9BTD8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RBM42Q9BTD8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RBM42Q9BTD8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RBM42Q9BTD8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RBM42Q9BTD8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RBM42Q9BTD8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RBM42Q9BTD8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RBM42Q9BTD8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RBM42Q9BTD8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RBM42Q9BTD8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RBM42Q9BTD8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RBM42Q9BTD8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RBM42Q9BTD8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RBM42Q9BTD8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RBM42Q9BTD8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RBM42Q9BTD8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RBM42Q9BTD8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RBM42Q9BTD8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RBM42Q9BTD8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RBM42Q9BTD8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RBM42Q9BTD8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RBM42Q9BTD8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RBM42Q9BTD8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
RBM42Q9BTD8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RBM42Q9BTD8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RBM42Q9BTD8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RBM42Q9BTD8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RBM42Q9BTD8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RBM42Q9BTD8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
RBM42Q9BTD8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RBM42Q9BTD8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RBM42Q9BTD8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RBM42Q9BTD8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RBM42Q9BTD8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
RBM42Q9BTD8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RBM42Q9BTD8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RBM42Q9BTD8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.81■■■■□ 3
RBM42Q9BTD8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RBM42Q9BTD8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RBM42Q9BTD8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
RBM42Q9BTD8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
RBM42Q9BTD8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RBM42Q9BTD8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RBM42Q9BTD8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
RBM42Q9BTD8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.79■■■■□ 3
RBM42Q9BTD8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
RBM42Q9BTD8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RBM42Q9BTD8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
RBM42Q9BTD8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
RBM42Q9BTD8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RBM42Q9BTD8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RBM42Q9BTD8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RBM42Q9BTD8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RBM42Q9BTD8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RBM42Q9BTD8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RBM42Q9BTD8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RBM42Q9BTD8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RBM42Q9BTD8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RBM42Q9BTD8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RBM42Q9BTD8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RBM42Q9BTD8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RBM42Q9BTD8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
RBM42Q9BTD8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RBM42Q9BTD8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RBM42Q9BTD8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RBM42Q9BTD8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RBM42Q9BTD8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
RBM42Q9BTD8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RBM42Q9BTD8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RBM42Q9BTD8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RBM42Q9BTD8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RBM42Q9BTD8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RBM42Q9BTD8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RBM42Q9BTD8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RBM42Q9BTD8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RBM42Q9BTD8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
RBM42Q9BTD8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RBM42Q9BTD8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RBM42Q9BTD8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RBM42Q9BTD8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RBM42Q9BTD8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RBM42Q9BTD8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms