Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RTKNQ9BST9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RTKNQ9BST9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RTKNQ9BST9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RTKNQ9BST9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RTKNQ9BST9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RTKNQ9BST9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RTKNQ9BST9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RTKNQ9BST9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RTKNQ9BST9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RTKNQ9BST9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RTKNQ9BST9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTKNQ9BST9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTKNQ9BST9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTKNQ9BST9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTKNQ9BST9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTKNQ9BST9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RTKNQ9BST9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RTKNQ9BST9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RTKNQ9BST9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTKNQ9BST9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTKNQ9BST9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTKNQ9BST9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RTKNQ9BST9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RTKNQ9BST9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RTKNQ9BST9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RTKNQ9BST9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RTKNQ9BST9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RTKNQ9BST9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RTKNQ9BST9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RTKNQ9BST9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RTKNQ9BST9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RTKNQ9BST9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RTKNQ9BST9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RTKNQ9BST9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RTKNQ9BST9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RTKNQ9BST9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RTKNQ9BST9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RTKNQ9BST9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RTKNQ9BST9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RTKNQ9BST9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RTKNQ9BST9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RTKNQ9BST9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RTKNQ9BST9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RTKNQ9BST9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RTKNQ9BST9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RTKNQ9BST9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RTKNQ9BST9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RTKNQ9BST9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RTKNQ9BST9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RTKNQ9BST9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RTKNQ9BST9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RTKNQ9BST9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RTKNQ9BST9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RTKNQ9BST9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RTKNQ9BST9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RTKNQ9BST9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RTKNQ9BST9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RTKNQ9BST9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RTKNQ9BST9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
RTKNQ9BST9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RTKNQ9BST9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RTKNQ9BST9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RTKNQ9BST9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RTKNQ9BST9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RTKNQ9BST9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RTKNQ9BST9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RTKNQ9BST9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RTKNQ9BST9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RTKNQ9BST9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RTKNQ9BST9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RTKNQ9BST9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RTKNQ9BST9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RTKNQ9BST9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RTKNQ9BST9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RTKNQ9BST9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RTKNQ9BST9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RTKNQ9BST9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RTKNQ9BST9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RTKNQ9BST9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RTKNQ9BST9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RTKNQ9BST9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RTKNQ9BST9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RTKNQ9BST9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RTKNQ9BST9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RTKNQ9BST9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTKNQ9BST9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTKNQ9BST9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RTKNQ9BST9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RTKNQ9BST9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTKNQ9BST9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTKNQ9BST9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTKNQ9BST9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTKNQ9BST9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTKNQ9BST9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTKNQ9BST9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RTKNQ9BST9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RTKNQ9BST9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RTKNQ9BST9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTKNQ9BST9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms