Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ15

NABP2, SOSS complex subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NABP2Q9BQ15 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NABP2Q9BQ15 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NABP2Q9BQ15 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NABP2Q9BQ15 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NABP2Q9BQ15 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NABP2Q9BQ15 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NABP2Q9BQ15 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NABP2Q9BQ15 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NABP2Q9BQ15 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NABP2Q9BQ15 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NABP2Q9BQ15 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NABP2Q9BQ15 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NABP2Q9BQ15 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NABP2Q9BQ15 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NABP2Q9BQ15 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NABP2Q9BQ15 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NABP2Q9BQ15 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NABP2Q9BQ15 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NABP2Q9BQ15 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NABP2Q9BQ15 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NABP2Q9BQ15 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NABP2Q9BQ15 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NABP2Q9BQ15 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NABP2Q9BQ15 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NABP2Q9BQ15 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NABP2Q9BQ15 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NABP2Q9BQ15 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NABP2Q9BQ15 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NABP2Q9BQ15 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NABP2Q9BQ15 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NABP2Q9BQ15 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NABP2Q9BQ15 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NABP2Q9BQ15 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NABP2Q9BQ15 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NABP2Q9BQ15 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NABP2Q9BQ15 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NABP2Q9BQ15 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NABP2Q9BQ15 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NABP2Q9BQ15 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NABP2Q9BQ15 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NABP2Q9BQ15 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NABP2Q9BQ15 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NABP2Q9BQ15 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NABP2Q9BQ15 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NABP2Q9BQ15 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NABP2Q9BQ15 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NABP2Q9BQ15 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NABP2Q9BQ15 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NABP2Q9BQ15 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NABP2Q9BQ15 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NABP2Q9BQ15 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NABP2Q9BQ15 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NABP2Q9BQ15 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NABP2Q9BQ15 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NABP2Q9BQ15 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NABP2Q9BQ15 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NABP2Q9BQ15 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NABP2Q9BQ15 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NABP2Q9BQ15 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NABP2Q9BQ15 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NABP2Q9BQ15 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NABP2Q9BQ15 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NABP2Q9BQ15 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NABP2Q9BQ15 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NABP2Q9BQ15 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NABP2Q9BQ15 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NABP2Q9BQ15 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NABP2Q9BQ15 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NABP2Q9BQ15 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NABP2Q9BQ15 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NABP2Q9BQ15 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NABP2Q9BQ15 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NABP2Q9BQ15 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NABP2Q9BQ15 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NABP2Q9BQ15 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NABP2Q9BQ15 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NABP2Q9BQ15 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NABP2Q9BQ15 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NABP2Q9BQ15 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NABP2Q9BQ15 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NABP2Q9BQ15 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NABP2Q9BQ15 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NABP2Q9BQ15 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NABP2Q9BQ15 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NABP2Q9BQ15 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NABP2Q9BQ15 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NABP2Q9BQ15 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NABP2Q9BQ15 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NABP2Q9BQ15 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NABP2Q9BQ15 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NABP2Q9BQ15 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NABP2Q9BQ15 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NABP2Q9BQ15 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NABP2Q9BQ15 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NABP2Q9BQ15 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NABP2Q9BQ15 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NABP2Q9BQ15 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NABP2Q9BQ15 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NABP2Q9BQ15 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NABP2Q9BQ15 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms