Protein–RNA interactions for Protein: Q99865

SPIN2A, Spindlin-2A, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN2AQ99865 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SPIN2AQ99865 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SPIN2AQ99865 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SPIN2AQ99865 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPIN2AQ99865 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPIN2AQ99865 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPIN2AQ99865 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPIN2AQ99865 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPIN2AQ99865 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPIN2AQ99865 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SPIN2AQ99865 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPIN2AQ99865 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPIN2AQ99865 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPIN2AQ99865 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPIN2AQ99865 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPIN2AQ99865 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SPIN2AQ99865 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPIN2AQ99865 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPIN2AQ99865 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPIN2AQ99865 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPIN2AQ99865 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPIN2AQ99865 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPIN2AQ99865 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPIN2AQ99865 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPIN2AQ99865 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPIN2AQ99865 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPIN2AQ99865 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPIN2AQ99865 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPIN2AQ99865 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPIN2AQ99865 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPIN2AQ99865 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPIN2AQ99865 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPIN2AQ99865 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPIN2AQ99865 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPIN2AQ99865 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPIN2AQ99865 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPIN2AQ99865 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPIN2AQ99865 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPIN2AQ99865 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPIN2AQ99865 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPIN2AQ99865 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPIN2AQ99865 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPIN2AQ99865 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPIN2AQ99865 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPIN2AQ99865 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPIN2AQ99865 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPIN2AQ99865 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPIN2AQ99865 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPIN2AQ99865 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPIN2AQ99865 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPIN2AQ99865 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPIN2AQ99865 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPIN2AQ99865 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SPIN2AQ99865 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPIN2AQ99865 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPIN2AQ99865 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPIN2AQ99865 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPIN2AQ99865 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPIN2AQ99865 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPIN2AQ99865 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPIN2AQ99865 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPIN2AQ99865 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPIN2AQ99865 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPIN2AQ99865 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPIN2AQ99865 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPIN2AQ99865 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPIN2AQ99865 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPIN2AQ99865 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPIN2AQ99865 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPIN2AQ99865 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPIN2AQ99865 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPIN2AQ99865 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPIN2AQ99865 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPIN2AQ99865 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPIN2AQ99865 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPIN2AQ99865 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPIN2AQ99865 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPIN2AQ99865 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPIN2AQ99865 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPIN2AQ99865 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPIN2AQ99865 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPIN2AQ99865 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPIN2AQ99865 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPIN2AQ99865 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPIN2AQ99865 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPIN2AQ99865 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPIN2AQ99865 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPIN2AQ99865 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPIN2AQ99865 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPIN2AQ99865 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPIN2AQ99865 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPIN2AQ99865 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SPIN2AQ99865 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPIN2AQ99865 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPIN2AQ99865 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPIN2AQ99865 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPIN2AQ99865 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPIN2AQ99865 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPIN2AQ99865 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPIN2AQ99865 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.8 ms