Protein–RNA interactions for Protein: Q99828

CIB1, Calcium and integrin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIB1Q99828 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CIB1Q99828 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CIB1Q99828 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CIB1Q99828 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CIB1Q99828 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CIB1Q99828 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CIB1Q99828 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CIB1Q99828 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CIB1Q99828 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CIB1Q99828 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CIB1Q99828 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CIB1Q99828 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CIB1Q99828 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIB1Q99828 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIB1Q99828 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIB1Q99828 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIB1Q99828 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CIB1Q99828 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CIB1Q99828 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CIB1Q99828 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CIB1Q99828 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIB1Q99828 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIB1Q99828 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIB1Q99828 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIB1Q99828 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CIB1Q99828 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CIB1Q99828 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CIB1Q99828 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CIB1Q99828 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CIB1Q99828 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CIB1Q99828 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CIB1Q99828 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CIB1Q99828 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CIB1Q99828 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CIB1Q99828 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CIB1Q99828 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CIB1Q99828 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CIB1Q99828 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CIB1Q99828 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CIB1Q99828 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CIB1Q99828 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CIB1Q99828 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CIB1Q99828 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CIB1Q99828 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CIB1Q99828 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CIB1Q99828 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CIB1Q99828 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CIB1Q99828 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CIB1Q99828 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CIB1Q99828 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CIB1Q99828 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CIB1Q99828 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CIB1Q99828 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CIB1Q99828 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CIB1Q99828 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CIB1Q99828 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CIB1Q99828 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CIB1Q99828 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CIB1Q99828 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CIB1Q99828 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CIB1Q99828 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CIB1Q99828 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CIB1Q99828 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CIB1Q99828 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CIB1Q99828 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CIB1Q99828 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CIB1Q99828 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CIB1Q99828 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CIB1Q99828 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CIB1Q99828 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CIB1Q99828 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CIB1Q99828 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CIB1Q99828 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CIB1Q99828 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CIB1Q99828 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CIB1Q99828 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CIB1Q99828 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CIB1Q99828 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CIB1Q99828 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CIB1Q99828 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CIB1Q99828 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CIB1Q99828 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CIB1Q99828 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CIB1Q99828 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CIB1Q99828 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CIB1Q99828 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CIB1Q99828 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CIB1Q99828 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CIB1Q99828 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CIB1Q99828 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CIB1Q99828 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CIB1Q99828 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CIB1Q99828 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CIB1Q99828 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CIB1Q99828 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CIB1Q99828 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CIB1Q99828 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CIB1Q99828 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CIB1Q99828 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CIB1Q99828 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms