Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
MEIS3Q99687 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
MEIS3Q99687 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
MEIS3Q99687 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
MEIS3Q99687 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
MEIS3Q99687 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
MEIS3Q99687 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
MEIS3Q99687 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
MEIS3Q99687 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
MEIS3Q99687 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
MEIS3Q99687 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
MEIS3Q99687 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
MEIS3Q99687 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
MEIS3Q99687 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
MEIS3Q99687 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
MEIS3Q99687 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
MEIS3Q99687 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
MEIS3Q99687 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
MEIS3Q99687 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
MEIS3Q99687 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
MEIS3Q99687 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
MEIS3Q99687 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
MEIS3Q99687 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
MEIS3Q99687 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
MEIS3Q99687 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
MEIS3Q99687 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
MEIS3Q99687 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
MEIS3Q99687 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
MEIS3Q99687 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
MEIS3Q99687 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
MEIS3Q99687 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
MEIS3Q99687 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
MEIS3Q99687 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
MEIS3Q99687 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
MEIS3Q99687 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
MEIS3Q99687 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
MEIS3Q99687 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
MEIS3Q99687 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
MEIS3Q99687 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
MEIS3Q99687 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
MEIS3Q99687 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
MEIS3Q99687 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
MEIS3Q99687 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
MEIS3Q99687 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
MEIS3Q99687 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
MEIS3Q99687 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
MEIS3Q99687 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
MEIS3Q99687 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
MEIS3Q99687 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
MEIS3Q99687 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
MEIS3Q99687 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
MEIS3Q99687 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
MEIS3Q99687 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
MEIS3Q99687 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
MEIS3Q99687 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
MEIS3Q99687 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
MEIS3Q99687 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
MEIS3Q99687 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
MEIS3Q99687 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.81
MEIS3Q99687 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
MEIS3Q99687 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
MEIS3Q99687 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
MEIS3Q99687 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
MEIS3Q99687 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
MEIS3Q99687 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
MEIS3Q99687 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC32.55■■■□□ 2.8
MEIS3Q99687 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
MEIS3Q99687 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.54■■■□□ 2.8
MEIS3Q99687 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
MEIS3Q99687 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
MEIS3Q99687 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
MEIS3Q99687 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
MEIS3Q99687 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
MEIS3Q99687 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
MEIS3Q99687 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
MEIS3Q99687 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
MEIS3Q99687 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
MEIS3Q99687 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
MEIS3Q99687 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
MEIS3Q99687 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
MEIS3Q99687 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
MEIS3Q99687 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32.49■■■□□ 2.79
MEIS3Q99687 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
MEIS3Q99687 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
MEIS3Q99687 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
MEIS3Q99687 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
MEIS3Q99687 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
MEIS3Q99687 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
MEIS3Q99687 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
MEIS3Q99687 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
MEIS3Q99687 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
MEIS3Q99687 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
MEIS3Q99687 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
MEIS3Q99687 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
MEIS3Q99687 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
MEIS3Q99687 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
MEIS3Q99687 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
MEIS3Q99687 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
MEIS3Q99687 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
MEIS3Q99687 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms