Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCL13Q99616 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCL13Q99616 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCL13Q99616 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCL13Q99616 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCL13Q99616 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCL13Q99616 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCL13Q99616 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCL13Q99616 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCL13Q99616 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCL13Q99616 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCL13Q99616 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCL13Q99616 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCL13Q99616 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCL13Q99616 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCL13Q99616 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCL13Q99616 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCL13Q99616 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCL13Q99616 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCL13Q99616 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCL13Q99616 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCL13Q99616 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCL13Q99616 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCL13Q99616 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCL13Q99616 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCL13Q99616 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCL13Q99616 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCL13Q99616 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCL13Q99616 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCL13Q99616 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCL13Q99616 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCL13Q99616 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCL13Q99616 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCL13Q99616 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCL13Q99616 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCL13Q99616 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCL13Q99616 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCL13Q99616 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCL13Q99616 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCL13Q99616 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CCL13Q99616 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCL13Q99616 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCL13Q99616 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCL13Q99616 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCL13Q99616 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCL13Q99616 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL13Q99616 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL13Q99616 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL13Q99616 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL13Q99616 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL13Q99616 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL13Q99616 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL13Q99616 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL13Q99616 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL13Q99616 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL13Q99616 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL13Q99616 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL13Q99616 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL13Q99616 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL13Q99616 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL13Q99616 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL13Q99616 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL13Q99616 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL13Q99616 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL13Q99616 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL13Q99616 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL13Q99616 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL13Q99616 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL13Q99616 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCL13Q99616 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCL13Q99616 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCL13Q99616 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCL13Q99616 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCL13Q99616 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCL13Q99616 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCL13Q99616 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCL13Q99616 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCL13Q99616 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCL13Q99616 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCL13Q99616 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCL13Q99616 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCL13Q99616 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCL13Q99616 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCL13Q99616 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCL13Q99616 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCL13Q99616 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCL13Q99616 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL13Q99616 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL13Q99616 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL13Q99616 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL13Q99616 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCL13Q99616 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCL13Q99616 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCL13Q99616 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCL13Q99616 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCL13Q99616 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCL13Q99616 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCL13Q99616 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCL13Q99616 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCL13Q99616 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms