Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PFDN5Q99471 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PFDN5Q99471 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PFDN5Q99471 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PFDN5Q99471 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PFDN5Q99471 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PFDN5Q99471 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PFDN5Q99471 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PFDN5Q99471 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PFDN5Q99471 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PFDN5Q99471 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PFDN5Q99471 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PFDN5Q99471 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PFDN5Q99471 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PFDN5Q99471 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PFDN5Q99471 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PFDN5Q99471 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PFDN5Q99471 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PFDN5Q99471 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PFDN5Q99471 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PFDN5Q99471 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PFDN5Q99471 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PFDN5Q99471 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PFDN5Q99471 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PFDN5Q99471 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PFDN5Q99471 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PFDN5Q99471 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PFDN5Q99471 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PFDN5Q99471 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PFDN5Q99471 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PFDN5Q99471 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PFDN5Q99471 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PFDN5Q99471 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PFDN5Q99471 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PFDN5Q99471 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PFDN5Q99471 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PFDN5Q99471 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PFDN5Q99471 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PFDN5Q99471 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PFDN5Q99471 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PFDN5Q99471 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PFDN5Q99471 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PFDN5Q99471 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PFDN5Q99471 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PFDN5Q99471 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PFDN5Q99471 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PFDN5Q99471 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PFDN5Q99471 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PFDN5Q99471 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PFDN5Q99471 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PFDN5Q99471 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PFDN5Q99471 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PFDN5Q99471 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PFDN5Q99471 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PFDN5Q99471 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PFDN5Q99471 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PFDN5Q99471 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PFDN5Q99471 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PFDN5Q99471 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PFDN5Q99471 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PFDN5Q99471 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PFDN5Q99471 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PFDN5Q99471 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PFDN5Q99471 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PFDN5Q99471 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PFDN5Q99471 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PFDN5Q99471 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PFDN5Q99471 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PFDN5Q99471 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PFDN5Q99471 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PFDN5Q99471 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PFDN5Q99471 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PFDN5Q99471 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PFDN5Q99471 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PFDN5Q99471 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PFDN5Q99471 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PFDN5Q99471 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PFDN5Q99471 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PFDN5Q99471 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PFDN5Q99471 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PFDN5Q99471 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PFDN5Q99471 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PFDN5Q99471 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PFDN5Q99471 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PFDN5Q99471 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PFDN5Q99471 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PFDN5Q99471 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PFDN5Q99471 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PFDN5Q99471 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PFDN5Q99471 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PFDN5Q99471 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PFDN5Q99471 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PFDN5Q99471 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PFDN5Q99471 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PFDN5Q99471 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PFDN5Q99471 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PFDN5Q99471 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PFDN5Q99471 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PFDN5Q99471 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PFDN5Q99471 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms