Protein–RNA interactions for Protein: Q96S42

NODAL, Nodal homolog, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NODALQ96S42 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NODALQ96S42 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NODALQ96S42 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NODALQ96S42 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NODALQ96S42 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NODALQ96S42 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NODALQ96S42 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NODALQ96S42 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NODALQ96S42 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NODALQ96S42 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NODALQ96S42 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NODALQ96S42 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NODALQ96S42 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NODALQ96S42 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NODALQ96S42 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NODALQ96S42 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NODALQ96S42 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NODALQ96S42 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NODALQ96S42 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NODALQ96S42 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NODALQ96S42 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NODALQ96S42 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NODALQ96S42 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NODALQ96S42 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NODALQ96S42 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NODALQ96S42 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NODALQ96S42 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NODALQ96S42 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NODALQ96S42 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NODALQ96S42 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NODALQ96S42 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NODALQ96S42 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NODALQ96S42 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NODALQ96S42 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NODALQ96S42 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NODALQ96S42 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NODALQ96S42 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NODALQ96S42 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NODALQ96S42 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NODALQ96S42 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NODALQ96S42 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NODALQ96S42 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NODALQ96S42 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NODALQ96S42 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NODALQ96S42 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NODALQ96S42 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NODALQ96S42 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NODALQ96S42 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NODALQ96S42 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NODALQ96S42 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NODALQ96S42 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NODALQ96S42 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NODALQ96S42 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NODALQ96S42 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NODALQ96S42 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NODALQ96S42 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NODALQ96S42 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NODALQ96S42 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NODALQ96S42 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NODALQ96S42 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NODALQ96S42 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NODALQ96S42 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NODALQ96S42 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NODALQ96S42 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NODALQ96S42 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NODALQ96S42 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NODALQ96S42 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NODALQ96S42 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NODALQ96S42 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NODALQ96S42 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NODALQ96S42 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NODALQ96S42 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NODALQ96S42 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NODALQ96S42 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NODALQ96S42 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NODALQ96S42 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NODALQ96S42 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NODALQ96S42 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NODALQ96S42 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NODALQ96S42 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NODALQ96S42 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
NODALQ96S42 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NODALQ96S42 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NODALQ96S42 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NODALQ96S42 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NODALQ96S42 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NODALQ96S42 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NODALQ96S42 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NODALQ96S42 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NODALQ96S42 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NODALQ96S42 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NODALQ96S42 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NODALQ96S42 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NODALQ96S42 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NODALQ96S42 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NODALQ96S42 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NODALQ96S42 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NODALQ96S42 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NODALQ96S42 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NODALQ96S42 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms