Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC38A2Q96QD8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC38A2Q96QD8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC38A2Q96QD8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC38A2Q96QD8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC38A2Q96QD8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC38A2Q96QD8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC38A2Q96QD8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC38A2Q96QD8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC38A2Q96QD8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC38A2Q96QD8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC38A2Q96QD8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC38A2Q96QD8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC38A2Q96QD8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC38A2Q96QD8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC38A2Q96QD8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC38A2Q96QD8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC38A2Q96QD8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC38A2Q96QD8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC38A2Q96QD8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC38A2Q96QD8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC38A2Q96QD8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC38A2Q96QD8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC38A2Q96QD8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC38A2Q96QD8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC38A2Q96QD8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC38A2Q96QD8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC38A2Q96QD8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC38A2Q96QD8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC38A2Q96QD8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC38A2Q96QD8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC38A2Q96QD8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC38A2Q96QD8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC38A2Q96QD8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC38A2Q96QD8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC38A2Q96QD8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC38A2Q96QD8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC38A2Q96QD8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC38A2Q96QD8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC38A2Q96QD8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SLC38A2Q96QD8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC38A2Q96QD8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC38A2Q96QD8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC38A2Q96QD8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC38A2Q96QD8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC38A2Q96QD8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC38A2Q96QD8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC38A2Q96QD8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC38A2Q96QD8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC38A2Q96QD8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC38A2Q96QD8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC38A2Q96QD8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC38A2Q96QD8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC38A2Q96QD8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC38A2Q96QD8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC38A2Q96QD8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC38A2Q96QD8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC38A2Q96QD8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC38A2Q96QD8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC38A2Q96QD8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC38A2Q96QD8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC38A2Q96QD8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC38A2Q96QD8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC38A2Q96QD8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A2Q96QD8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A2Q96QD8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A2Q96QD8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A2Q96QD8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A2Q96QD8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A2Q96QD8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A2Q96QD8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC38A2Q96QD8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC38A2Q96QD8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC38A2Q96QD8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC38A2Q96QD8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC38A2Q96QD8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC38A2Q96QD8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC38A2Q96QD8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC38A2Q96QD8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC38A2Q96QD8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC38A2Q96QD8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC38A2Q96QD8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC38A2Q96QD8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC38A2Q96QD8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC38A2Q96QD8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC38A2Q96QD8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC38A2Q96QD8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC38A2Q96QD8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC38A2Q96QD8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC38A2Q96QD8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC38A2Q96QD8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC38A2Q96QD8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC38A2Q96QD8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC38A2Q96QD8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC38A2Q96QD8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC38A2Q96QD8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC38A2Q96QD8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC38A2Q96QD8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC38A2Q96QD8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC38A2Q96QD8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms