Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
ALS2Q96Q42 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
ALS2Q96Q42 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ALS2Q96Q42 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ALS2Q96Q42 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ALS2Q96Q42 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ALS2Q96Q42 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
ALS2Q96Q42 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.33
ALS2Q96Q42 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC35.82■■■■□ 3.32
ALS2Q96Q42 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
ALS2Q96Q42 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
ALS2Q96Q42 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
ALS2Q96Q42 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
ALS2Q96Q42 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
ALS2Q96Q42 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
ALS2Q96Q42 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
ALS2Q96Q42 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
ALS2Q96Q42 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
ALS2Q96Q42 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
ALS2Q96Q42 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
ALS2Q96Q42 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
ALS2Q96Q42 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
ALS2Q96Q42 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ALS2Q96Q42 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ALS2Q96Q42 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
ALS2Q96Q42 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
ALS2Q96Q42 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ALS2Q96Q42 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
ALS2Q96Q42 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ALS2Q96Q42 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
ALS2Q96Q42 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
ALS2Q96Q42 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ALS2Q96Q42 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ALS2Q96Q42 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ALS2Q96Q42 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
ALS2Q96Q42 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
ALS2Q96Q42 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
ALS2Q96Q42 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
ALS2Q96Q42 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ALS2Q96Q42 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ALS2Q96Q42 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ALS2Q96Q42 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ALS2Q96Q42 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ALS2Q96Q42 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ALS2Q96Q42 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ALS2Q96Q42 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
ALS2Q96Q42 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ALS2Q96Q42 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ALS2Q96Q42 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ALS2Q96Q42 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
ALS2Q96Q42 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
ALS2Q96Q42 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
ALS2Q96Q42 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ALS2Q96Q42 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ALS2Q96Q42 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ALS2Q96Q42 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ALS2Q96Q42 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ALS2Q96Q42 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
ALS2Q96Q42 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
ALS2Q96Q42 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
ALS2Q96Q42 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
ALS2Q96Q42 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
ALS2Q96Q42 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
ALS2Q96Q42 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ALS2Q96Q42 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
ALS2Q96Q42 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
ALS2Q96Q42 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
ALS2Q96Q42 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC35.53■■■■□ 3.28
ALS2Q96Q42 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ALS2Q96Q42 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ALS2Q96Q42 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ALS2Q96Q42 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ALS2Q96Q42 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
ALS2Q96Q42 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
ALS2Q96Q42 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
ALS2Q96Q42 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
ALS2Q96Q42 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
ALS2Q96Q42 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
ALS2Q96Q42 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
ALS2Q96Q42 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
ALS2Q96Q42 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
ALS2Q96Q42 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
ALS2Q96Q42 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
ALS2Q96Q42 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
ALS2Q96Q42 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ALS2Q96Q42 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
ALS2Q96Q42 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
ALS2Q96Q42 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
ALS2Q96Q42 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ALS2Q96Q42 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ALS2Q96Q42 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
ALS2Q96Q42 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
ALS2Q96Q42 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC35.45■■■■□ 3.26
ALS2Q96Q42 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
ALS2Q96Q42 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
ALS2Q96Q42 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
ALS2Q96Q42 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
ALS2Q96Q42 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ALS2Q96Q42 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ALS2Q96Q42 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms