Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC9Q96Q05 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC9Q96Q05 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC9Q96Q05 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC9Q96Q05 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC9Q96Q05 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC9Q96Q05 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC9Q96Q05 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC9Q96Q05 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC9Q96Q05 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC9Q96Q05 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC9Q96Q05 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC9Q96Q05 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC9Q96Q05 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC9Q96Q05 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAPPC9Q96Q05 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAPPC9Q96Q05 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC9Q96Q05 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC9Q96Q05 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC9Q96Q05 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRAPPC9Q96Q05 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRAPPC9Q96Q05 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAPPC9Q96Q05 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAPPC9Q96Q05 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAPPC9Q96Q05 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAPPC9Q96Q05 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAPPC9Q96Q05 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAPPC9Q96Q05 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAPPC9Q96Q05 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC9Q96Q05 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC9Q96Q05 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC9Q96Q05 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC9Q96Q05 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC9Q96Q05 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC9Q96Q05 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC9Q96Q05 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC9Q96Q05 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC9Q96Q05 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC9Q96Q05 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC9Q96Q05 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC9Q96Q05 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC9Q96Q05 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC9Q96Q05 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC9Q96Q05 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC9Q96Q05 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC9Q96Q05 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC9Q96Q05 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC9Q96Q05 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC9Q96Q05 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC9Q96Q05 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC9Q96Q05 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC9Q96Q05 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAPPC9Q96Q05 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAPPC9Q96Q05 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAPPC9Q96Q05 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC9Q96Q05 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC9Q96Q05 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC9Q96Q05 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC9Q96Q05 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC9Q96Q05 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC9Q96Q05 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC9Q96Q05 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC9Q96Q05 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC9Q96Q05 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC9Q96Q05 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC9Q96Q05 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC9Q96Q05 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC9Q96Q05 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC9Q96Q05 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC9Q96Q05 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC9Q96Q05 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC9Q96Q05 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC9Q96Q05 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC9Q96Q05 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC9Q96Q05 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRAPPC9Q96Q05 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC9Q96Q05 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC9Q96Q05 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC9Q96Q05 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC9Q96Q05 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC9Q96Q05 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC9Q96Q05 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC9Q96Q05 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC9Q96Q05 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC9Q96Q05 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC9Q96Q05 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC9Q96Q05 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC9Q96Q05 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC9Q96Q05 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC9Q96Q05 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC9Q96Q05 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC9Q96Q05 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC9Q96Q05 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC9Q96Q05 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC9Q96Q05 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC9Q96Q05 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms