Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP8

GBP5, Guanylate-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP5Q96PP8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GBP5Q96PP8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GBP5Q96PP8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GBP5Q96PP8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GBP5Q96PP8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GBP5Q96PP8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GBP5Q96PP8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GBP5Q96PP8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GBP5Q96PP8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GBP5Q96PP8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GBP5Q96PP8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GBP5Q96PP8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GBP5Q96PP8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GBP5Q96PP8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GBP5Q96PP8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GBP5Q96PP8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GBP5Q96PP8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GBP5Q96PP8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GBP5Q96PP8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GBP5Q96PP8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GBP5Q96PP8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GBP5Q96PP8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GBP5Q96PP8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBP5Q96PP8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBP5Q96PP8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBP5Q96PP8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GBP5Q96PP8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBP5Q96PP8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GBP5Q96PP8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GBP5Q96PP8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GBP5Q96PP8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GBP5Q96PP8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GBP5Q96PP8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GBP5Q96PP8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GBP5Q96PP8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GBP5Q96PP8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GBP5Q96PP8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GBP5Q96PP8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GBP5Q96PP8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GBP5Q96PP8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GBP5Q96PP8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBP5Q96PP8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBP5Q96PP8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBP5Q96PP8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBP5Q96PP8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBP5Q96PP8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GBP5Q96PP8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBP5Q96PP8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBP5Q96PP8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBP5Q96PP8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBP5Q96PP8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBP5Q96PP8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBP5Q96PP8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBP5Q96PP8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBP5Q96PP8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBP5Q96PP8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBP5Q96PP8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBP5Q96PP8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBP5Q96PP8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBP5Q96PP8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBP5Q96PP8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBP5Q96PP8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBP5Q96PP8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBP5Q96PP8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBP5Q96PP8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GBP5Q96PP8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBP5Q96PP8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBP5Q96PP8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBP5Q96PP8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBP5Q96PP8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GBP5Q96PP8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GBP5Q96PP8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GBP5Q96PP8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GBP5Q96PP8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GBP5Q96PP8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GBP5Q96PP8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GBP5Q96PP8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GBP5Q96PP8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GBP5Q96PP8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GBP5Q96PP8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GBP5Q96PP8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GBP5Q96PP8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GBP5Q96PP8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GBP5Q96PP8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GBP5Q96PP8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GBP5Q96PP8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GBP5Q96PP8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GBP5Q96PP8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBP5Q96PP8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBP5Q96PP8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBP5Q96PP8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBP5Q96PP8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBP5Q96PP8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBP5Q96PP8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBP5Q96PP8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBP5Q96PP8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBP5Q96PP8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GBP5Q96PP8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GBP5Q96PP8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GBP5Q96PP8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms