Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
JSRP1Q96MG2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
JSRP1Q96MG2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
JSRP1Q96MG2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
JSRP1Q96MG2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
JSRP1Q96MG2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
JSRP1Q96MG2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
JSRP1Q96MG2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
JSRP1Q96MG2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
JSRP1Q96MG2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
JSRP1Q96MG2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
JSRP1Q96MG2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
JSRP1Q96MG2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
JSRP1Q96MG2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
JSRP1Q96MG2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
JSRP1Q96MG2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
JSRP1Q96MG2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
JSRP1Q96MG2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
JSRP1Q96MG2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
JSRP1Q96MG2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
JSRP1Q96MG2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
JSRP1Q96MG2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
JSRP1Q96MG2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
JSRP1Q96MG2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
JSRP1Q96MG2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
JSRP1Q96MG2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
JSRP1Q96MG2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
JSRP1Q96MG2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
JSRP1Q96MG2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
JSRP1Q96MG2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
JSRP1Q96MG2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
JSRP1Q96MG2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
JSRP1Q96MG2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
JSRP1Q96MG2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
JSRP1Q96MG2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
JSRP1Q96MG2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
JSRP1Q96MG2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
JSRP1Q96MG2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
JSRP1Q96MG2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
JSRP1Q96MG2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
JSRP1Q96MG2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
JSRP1Q96MG2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
JSRP1Q96MG2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
JSRP1Q96MG2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
JSRP1Q96MG2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
JSRP1Q96MG2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
JSRP1Q96MG2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
JSRP1Q96MG2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
JSRP1Q96MG2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
JSRP1Q96MG2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
JSRP1Q96MG2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
JSRP1Q96MG2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
JSRP1Q96MG2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
JSRP1Q96MG2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
JSRP1Q96MG2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
JSRP1Q96MG2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
JSRP1Q96MG2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
JSRP1Q96MG2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
JSRP1Q96MG2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
JSRP1Q96MG2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
JSRP1Q96MG2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
JSRP1Q96MG2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
JSRP1Q96MG2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
JSRP1Q96MG2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
JSRP1Q96MG2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
JSRP1Q96MG2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
JSRP1Q96MG2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
JSRP1Q96MG2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
JSRP1Q96MG2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
JSRP1Q96MG2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
JSRP1Q96MG2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
JSRP1Q96MG2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
JSRP1Q96MG2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
JSRP1Q96MG2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
JSRP1Q96MG2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
JSRP1Q96MG2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
JSRP1Q96MG2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
JSRP1Q96MG2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
JSRP1Q96MG2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
JSRP1Q96MG2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
JSRP1Q96MG2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
JSRP1Q96MG2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
JSRP1Q96MG2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
JSRP1Q96MG2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
JSRP1Q96MG2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
JSRP1Q96MG2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
JSRP1Q96MG2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
JSRP1Q96MG2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
JSRP1Q96MG2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
JSRP1Q96MG2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
JSRP1Q96MG2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
JSRP1Q96MG2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
JSRP1Q96MG2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
JSRP1Q96MG2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
JSRP1Q96MG2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
JSRP1Q96MG2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
JSRP1Q96MG2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
JSRP1Q96MG2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
JSRP1Q96MG2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
JSRP1Q96MG2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms