Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CCDC7Q96M83 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CCDC7Q96M83 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CCDC7Q96M83 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CCDC7Q96M83 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CCDC7Q96M83 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CCDC7Q96M83 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CCDC7Q96M83 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CCDC7Q96M83 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC36.51■■■■□ 3.43
CCDC7Q96M83 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
CCDC7Q96M83 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CCDC7Q96M83 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CCDC7Q96M83 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CCDC7Q96M83 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CCDC7Q96M83 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CCDC7Q96M83 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CCDC7Q96M83 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CCDC7Q96M83 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CCDC7Q96M83 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CCDC7Q96M83 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CCDC7Q96M83 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CCDC7Q96M83 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CCDC7Q96M83 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CCDC7Q96M83 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CCDC7Q96M83 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CCDC7Q96M83 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CCDC7Q96M83 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CCDC7Q96M83 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CCDC7Q96M83 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CCDC7Q96M83 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CCDC7Q96M83 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CCDC7Q96M83 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CCDC7Q96M83 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CCDC7Q96M83 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CCDC7Q96M83 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CCDC7Q96M83 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CCDC7Q96M83 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CCDC7Q96M83 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CCDC7Q96M83 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CCDC7Q96M83 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CCDC7Q96M83 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CCDC7Q96M83 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CCDC7Q96M83 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CCDC7Q96M83 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CCDC7Q96M83 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CCDC7Q96M83 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CCDC7Q96M83 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.42
CCDC7Q96M83 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CCDC7Q96M83 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CCDC7Q96M83 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
CCDC7Q96M83 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
CCDC7Q96M83 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CCDC7Q96M83 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CCDC7Q96M83 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CCDC7Q96M83 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CCDC7Q96M83 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
CCDC7Q96M83 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CCDC7Q96M83 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CCDC7Q96M83 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CCDC7Q96M83 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CCDC7Q96M83 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CCDC7Q96M83 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CCDC7Q96M83 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CCDC7Q96M83 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CCDC7Q96M83 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CCDC7Q96M83 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CCDC7Q96M83 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
CCDC7Q96M83 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CCDC7Q96M83 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CCDC7Q96M83 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CCDC7Q96M83 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
CCDC7Q96M83 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CCDC7Q96M83 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CCDC7Q96M83 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CCDC7Q96M83 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CCDC7Q96M83 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CCDC7Q96M83 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CCDC7Q96M83 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CCDC7Q96M83 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
CCDC7Q96M83 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CCDC7Q96M83 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CCDC7Q96M83 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CCDC7Q96M83 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CCDC7Q96M83 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CCDC7Q96M83 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CCDC7Q96M83 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CCDC7Q96M83 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
CCDC7Q96M83 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CCDC7Q96M83 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CCDC7Q96M83 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
CCDC7Q96M83 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CCDC7Q96M83 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CCDC7Q96M83 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CCDC7Q96M83 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CCDC7Q96M83 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CCDC7Q96M83 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CCDC7Q96M83 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CCDC7Q96M83 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CCDC7Q96M83 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CCDC7Q96M83 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms