Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPGRIP1Q96KN7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPGRIP1Q96KN7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPGRIP1Q96KN7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RPGRIP1Q96KN7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPGRIP1Q96KN7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPGRIP1Q96KN7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPGRIP1Q96KN7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RPGRIP1Q96KN7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPGRIP1Q96KN7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPGRIP1Q96KN7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPGRIP1Q96KN7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPGRIP1Q96KN7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPGRIP1Q96KN7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPGRIP1Q96KN7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPGRIP1Q96KN7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPGRIP1Q96KN7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RPGRIP1Q96KN7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPGRIP1Q96KN7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPGRIP1Q96KN7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RPGRIP1Q96KN7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPGRIP1Q96KN7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPGRIP1Q96KN7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPGRIP1Q96KN7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPGRIP1Q96KN7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPGRIP1Q96KN7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPGRIP1Q96KN7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RPGRIP1Q96KN7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RPGRIP1Q96KN7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RPGRIP1Q96KN7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RPGRIP1Q96KN7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RPGRIP1Q96KN7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPGRIP1Q96KN7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPGRIP1Q96KN7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RPGRIP1Q96KN7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPGRIP1Q96KN7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RPGRIP1Q96KN7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
RPGRIP1Q96KN7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPGRIP1Q96KN7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPGRIP1Q96KN7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPGRIP1Q96KN7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPGRIP1Q96KN7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPGRIP1Q96KN7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPGRIP1Q96KN7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPGRIP1Q96KN7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPGRIP1Q96KN7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPGRIP1Q96KN7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPGRIP1Q96KN7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPGRIP1Q96KN7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPGRIP1Q96KN7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPGRIP1Q96KN7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPGRIP1Q96KN7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPGRIP1Q96KN7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPGRIP1Q96KN7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPGRIP1Q96KN7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RPGRIP1Q96KN7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPGRIP1Q96KN7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPGRIP1Q96KN7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPGRIP1Q96KN7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPGRIP1Q96KN7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPGRIP1Q96KN7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPGRIP1Q96KN7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPGRIP1Q96KN7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RPGRIP1Q96KN7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPGRIP1Q96KN7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPGRIP1Q96KN7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPGRIP1Q96KN7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPGRIP1Q96KN7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPGRIP1Q96KN7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPGRIP1Q96KN7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPGRIP1Q96KN7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPGRIP1Q96KN7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPGRIP1Q96KN7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPGRIP1Q96KN7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPGRIP1Q96KN7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPGRIP1Q96KN7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPGRIP1Q96KN7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPGRIP1Q96KN7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPGRIP1Q96KN7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPGRIP1Q96KN7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPGRIP1Q96KN7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPGRIP1Q96KN7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPGRIP1Q96KN7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPGRIP1Q96KN7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPGRIP1Q96KN7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPGRIP1Q96KN7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPGRIP1Q96KN7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPGRIP1Q96KN7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPGRIP1Q96KN7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPGRIP1Q96KN7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPGRIP1Q96KN7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPGRIP1Q96KN7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPGRIP1Q96KN7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPGRIP1Q96KN7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPGRIP1Q96KN7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPGRIP1Q96KN7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPGRIP1Q96KN7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPGRIP1Q96KN7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPGRIP1Q96KN7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPGRIP1Q96KN7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms