Protein–RNA interactions for Protein: Q96KA5

CLPTM1L, Cleft lip and palate transmembrane protein 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1LQ96KA5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLPTM1LQ96KA5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLPTM1LQ96KA5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLPTM1LQ96KA5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLPTM1LQ96KA5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLPTM1LQ96KA5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLPTM1LQ96KA5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLPTM1LQ96KA5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLPTM1LQ96KA5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLPTM1LQ96KA5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLPTM1LQ96KA5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLPTM1LQ96KA5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CLPTM1LQ96KA5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLPTM1LQ96KA5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLPTM1LQ96KA5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLPTM1LQ96KA5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLPTM1LQ96KA5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLPTM1LQ96KA5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CLPTM1LQ96KA5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLPTM1LQ96KA5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLPTM1LQ96KA5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLPTM1LQ96KA5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLPTM1LQ96KA5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLPTM1LQ96KA5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLPTM1LQ96KA5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLPTM1LQ96KA5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLPTM1LQ96KA5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLPTM1LQ96KA5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLPTM1LQ96KA5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLPTM1LQ96KA5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLPTM1LQ96KA5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLPTM1LQ96KA5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLPTM1LQ96KA5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLPTM1LQ96KA5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLPTM1LQ96KA5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLPTM1LQ96KA5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLPTM1LQ96KA5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLPTM1LQ96KA5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLPTM1LQ96KA5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLPTM1LQ96KA5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLPTM1LQ96KA5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLPTM1LQ96KA5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLPTM1LQ96KA5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLPTM1LQ96KA5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLPTM1LQ96KA5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLPTM1LQ96KA5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLPTM1LQ96KA5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLPTM1LQ96KA5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLPTM1LQ96KA5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLPTM1LQ96KA5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLPTM1LQ96KA5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CLPTM1LQ96KA5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLPTM1LQ96KA5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLPTM1LQ96KA5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLPTM1LQ96KA5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLPTM1LQ96KA5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLPTM1LQ96KA5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLPTM1LQ96KA5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLPTM1LQ96KA5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLPTM1LQ96KA5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLPTM1LQ96KA5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLPTM1LQ96KA5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLPTM1LQ96KA5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLPTM1LQ96KA5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLPTM1LQ96KA5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLPTM1LQ96KA5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLPTM1LQ96KA5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLPTM1LQ96KA5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLPTM1LQ96KA5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLPTM1LQ96KA5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CLPTM1LQ96KA5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLPTM1LQ96KA5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLPTM1LQ96KA5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLPTM1LQ96KA5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLPTM1LQ96KA5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLPTM1LQ96KA5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLPTM1LQ96KA5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLPTM1LQ96KA5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLPTM1LQ96KA5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLPTM1LQ96KA5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLPTM1LQ96KA5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLPTM1LQ96KA5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLPTM1LQ96KA5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLPTM1LQ96KA5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLPTM1LQ96KA5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLPTM1LQ96KA5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLPTM1LQ96KA5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLPTM1LQ96KA5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLPTM1LQ96KA5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CLPTM1LQ96KA5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLPTM1LQ96KA5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLPTM1LQ96KA5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLPTM1LQ96KA5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLPTM1LQ96KA5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLPTM1LQ96KA5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLPTM1LQ96KA5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLPTM1LQ96KA5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLPTM1LQ96KA5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLPTM1LQ96KA5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLPTM1LQ96KA5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.3 ms