Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN0

LCOR, Ligand-dependent corepressor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCORQ96JN0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCORQ96JN0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCORQ96JN0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCORQ96JN0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCORQ96JN0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCORQ96JN0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LCORQ96JN0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LCORQ96JN0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LCORQ96JN0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LCORQ96JN0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LCORQ96JN0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LCORQ96JN0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LCORQ96JN0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCORQ96JN0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCORQ96JN0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCORQ96JN0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCORQ96JN0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LCORQ96JN0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LCORQ96JN0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LCORQ96JN0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LCORQ96JN0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCORQ96JN0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCORQ96JN0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCORQ96JN0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCORQ96JN0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCORQ96JN0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCORQ96JN0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCORQ96JN0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCORQ96JN0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCORQ96JN0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCORQ96JN0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCORQ96JN0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCORQ96JN0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCORQ96JN0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCORQ96JN0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCORQ96JN0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCORQ96JN0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCORQ96JN0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCORQ96JN0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCORQ96JN0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCORQ96JN0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LCORQ96JN0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCORQ96JN0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCORQ96JN0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LCORQ96JN0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCORQ96JN0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCORQ96JN0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCORQ96JN0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCORQ96JN0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCORQ96JN0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCORQ96JN0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCORQ96JN0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCORQ96JN0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCORQ96JN0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCORQ96JN0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCORQ96JN0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCORQ96JN0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCORQ96JN0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCORQ96JN0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCORQ96JN0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LCORQ96JN0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCORQ96JN0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCORQ96JN0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCORQ96JN0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCORQ96JN0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCORQ96JN0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCORQ96JN0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCORQ96JN0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCORQ96JN0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCORQ96JN0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCORQ96JN0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCORQ96JN0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LCORQ96JN0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCORQ96JN0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCORQ96JN0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCORQ96JN0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCORQ96JN0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LCORQ96JN0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LCORQ96JN0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCORQ96JN0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCORQ96JN0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCORQ96JN0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCORQ96JN0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCORQ96JN0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCORQ96JN0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCORQ96JN0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCORQ96JN0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LCORQ96JN0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LCORQ96JN0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCORQ96JN0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LCORQ96JN0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCORQ96JN0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCORQ96JN0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCORQ96JN0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCORQ96JN0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCORQ96JN0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCORQ96JN0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCORQ96JN0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LCORQ96JN0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LCORQ96JN0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms