Protein–RNA interactions for Protein: Q96HS1

PGAM5, Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM5Q96HS1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGAM5Q96HS1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGAM5Q96HS1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGAM5Q96HS1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGAM5Q96HS1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGAM5Q96HS1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGAM5Q96HS1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGAM5Q96HS1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PGAM5Q96HS1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PGAM5Q96HS1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGAM5Q96HS1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGAM5Q96HS1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGAM5Q96HS1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGAM5Q96HS1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGAM5Q96HS1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGAM5Q96HS1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGAM5Q96HS1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGAM5Q96HS1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGAM5Q96HS1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGAM5Q96HS1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGAM5Q96HS1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGAM5Q96HS1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PGAM5Q96HS1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PGAM5Q96HS1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGAM5Q96HS1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGAM5Q96HS1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGAM5Q96HS1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGAM5Q96HS1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGAM5Q96HS1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGAM5Q96HS1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGAM5Q96HS1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGAM5Q96HS1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGAM5Q96HS1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PGAM5Q96HS1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGAM5Q96HS1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PGAM5Q96HS1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PGAM5Q96HS1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGAM5Q96HS1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGAM5Q96HS1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGAM5Q96HS1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGAM5Q96HS1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PGAM5Q96HS1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGAM5Q96HS1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGAM5Q96HS1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGAM5Q96HS1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGAM5Q96HS1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGAM5Q96HS1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGAM5Q96HS1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGAM5Q96HS1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGAM5Q96HS1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGAM5Q96HS1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGAM5Q96HS1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGAM5Q96HS1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGAM5Q96HS1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGAM5Q96HS1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGAM5Q96HS1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGAM5Q96HS1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGAM5Q96HS1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGAM5Q96HS1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGAM5Q96HS1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGAM5Q96HS1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGAM5Q96HS1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGAM5Q96HS1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGAM5Q96HS1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGAM5Q96HS1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGAM5Q96HS1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGAM5Q96HS1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGAM5Q96HS1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGAM5Q96HS1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGAM5Q96HS1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGAM5Q96HS1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGAM5Q96HS1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGAM5Q96HS1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGAM5Q96HS1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGAM5Q96HS1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGAM5Q96HS1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGAM5Q96HS1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGAM5Q96HS1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGAM5Q96HS1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGAM5Q96HS1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGAM5Q96HS1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGAM5Q96HS1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGAM5Q96HS1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGAM5Q96HS1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PGAM5Q96HS1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGAM5Q96HS1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGAM5Q96HS1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGAM5Q96HS1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGAM5Q96HS1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGAM5Q96HS1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGAM5Q96HS1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGAM5Q96HS1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGAM5Q96HS1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGAM5Q96HS1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGAM5Q96HS1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGAM5Q96HS1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGAM5Q96HS1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGAM5Q96HS1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGAM5Q96HS1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGAM5Q96HS1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms