Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX9

APIP, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APIPQ96GX9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APIPQ96GX9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APIPQ96GX9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APIPQ96GX9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APIPQ96GX9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
APIPQ96GX9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APIPQ96GX9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APIPQ96GX9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APIPQ96GX9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APIPQ96GX9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APIPQ96GX9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APIPQ96GX9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APIPQ96GX9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APIPQ96GX9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APIPQ96GX9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APIPQ96GX9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APIPQ96GX9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APIPQ96GX9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APIPQ96GX9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APIPQ96GX9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APIPQ96GX9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APIPQ96GX9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APIPQ96GX9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APIPQ96GX9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APIPQ96GX9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APIPQ96GX9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
APIPQ96GX9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
APIPQ96GX9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APIPQ96GX9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APIPQ96GX9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APIPQ96GX9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
APIPQ96GX9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APIPQ96GX9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APIPQ96GX9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APIPQ96GX9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APIPQ96GX9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APIPQ96GX9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APIPQ96GX9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APIPQ96GX9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APIPQ96GX9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APIPQ96GX9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APIPQ96GX9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APIPQ96GX9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APIPQ96GX9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APIPQ96GX9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APIPQ96GX9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APIPQ96GX9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APIPQ96GX9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APIPQ96GX9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
APIPQ96GX9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APIPQ96GX9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APIPQ96GX9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APIPQ96GX9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APIPQ96GX9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APIPQ96GX9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APIPQ96GX9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APIPQ96GX9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APIPQ96GX9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APIPQ96GX9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APIPQ96GX9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APIPQ96GX9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APIPQ96GX9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APIPQ96GX9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APIPQ96GX9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APIPQ96GX9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APIPQ96GX9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APIPQ96GX9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APIPQ96GX9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APIPQ96GX9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APIPQ96GX9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APIPQ96GX9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APIPQ96GX9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
APIPQ96GX9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APIPQ96GX9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APIPQ96GX9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APIPQ96GX9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APIPQ96GX9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APIPQ96GX9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APIPQ96GX9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
APIPQ96GX9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
APIPQ96GX9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APIPQ96GX9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APIPQ96GX9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APIPQ96GX9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APIPQ96GX9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APIPQ96GX9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APIPQ96GX9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APIPQ96GX9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APIPQ96GX9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APIPQ96GX9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APIPQ96GX9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APIPQ96GX9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APIPQ96GX9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APIPQ96GX9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APIPQ96GX9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APIPQ96GX9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APIPQ96GX9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APIPQ96GX9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APIPQ96GX9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APIPQ96GX9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms