Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
LTV1Q96GA3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
LTV1Q96GA3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
LTV1Q96GA3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
LTV1Q96GA3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
LTV1Q96GA3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
LTV1Q96GA3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
LTV1Q96GA3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
LTV1Q96GA3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
LTV1Q96GA3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
LTV1Q96GA3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
LTV1Q96GA3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
LTV1Q96GA3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
LTV1Q96GA3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
LTV1Q96GA3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
LTV1Q96GA3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
LTV1Q96GA3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
LTV1Q96GA3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
LTV1Q96GA3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
LTV1Q96GA3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
LTV1Q96GA3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
LTV1Q96GA3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
LTV1Q96GA3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
LTV1Q96GA3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
LTV1Q96GA3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
LTV1Q96GA3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
LTV1Q96GA3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
LTV1Q96GA3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
LTV1Q96GA3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
LTV1Q96GA3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
LTV1Q96GA3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
LTV1Q96GA3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
LTV1Q96GA3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
LTV1Q96GA3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
LTV1Q96GA3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
LTV1Q96GA3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
LTV1Q96GA3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
LTV1Q96GA3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
LTV1Q96GA3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
LTV1Q96GA3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
LTV1Q96GA3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
LTV1Q96GA3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
LTV1Q96GA3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
LTV1Q96GA3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
LTV1Q96GA3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
LTV1Q96GA3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
LTV1Q96GA3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
LTV1Q96GA3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
LTV1Q96GA3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
LTV1Q96GA3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
LTV1Q96GA3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
LTV1Q96GA3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
LTV1Q96GA3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
LTV1Q96GA3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.85■■■■□ 3.17
LTV1Q96GA3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
LTV1Q96GA3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
LTV1Q96GA3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
LTV1Q96GA3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
LTV1Q96GA3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
LTV1Q96GA3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
LTV1Q96GA3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
LTV1Q96GA3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
LTV1Q96GA3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
LTV1Q96GA3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
LTV1Q96GA3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
LTV1Q96GA3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
LTV1Q96GA3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
LTV1Q96GA3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
LTV1Q96GA3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
LTV1Q96GA3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
LTV1Q96GA3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
LTV1Q96GA3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
LTV1Q96GA3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
LTV1Q96GA3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
LTV1Q96GA3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
LTV1Q96GA3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
LTV1Q96GA3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
LTV1Q96GA3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
LTV1Q96GA3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
LTV1Q96GA3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
LTV1Q96GA3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
LTV1Q96GA3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
LTV1Q96GA3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
LTV1Q96GA3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.14
LTV1Q96GA3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
LTV1Q96GA3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
LTV1Q96GA3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
LTV1Q96GA3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
LTV1Q96GA3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
LTV1Q96GA3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
LTV1Q96GA3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
LTV1Q96GA3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
LTV1Q96GA3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
LTV1Q96GA3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
LTV1Q96GA3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
LTV1Q96GA3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
LTV1Q96GA3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
LTV1Q96GA3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
LTV1Q96GA3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
LTV1Q96GA3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.3 ms