Protein–RNA interactions for Protein: Q96EF6

FBXO17, F-box only protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO17Q96EF6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO17Q96EF6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO17Q96EF6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO17Q96EF6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO17Q96EF6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO17Q96EF6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO17Q96EF6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO17Q96EF6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO17Q96EF6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FBXO17Q96EF6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO17Q96EF6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO17Q96EF6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO17Q96EF6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO17Q96EF6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO17Q96EF6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO17Q96EF6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO17Q96EF6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO17Q96EF6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO17Q96EF6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO17Q96EF6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO17Q96EF6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO17Q96EF6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO17Q96EF6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO17Q96EF6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO17Q96EF6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO17Q96EF6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO17Q96EF6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO17Q96EF6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO17Q96EF6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO17Q96EF6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO17Q96EF6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO17Q96EF6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO17Q96EF6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO17Q96EF6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO17Q96EF6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO17Q96EF6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO17Q96EF6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO17Q96EF6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO17Q96EF6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO17Q96EF6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO17Q96EF6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO17Q96EF6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO17Q96EF6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO17Q96EF6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO17Q96EF6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO17Q96EF6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO17Q96EF6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO17Q96EF6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO17Q96EF6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO17Q96EF6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO17Q96EF6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO17Q96EF6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO17Q96EF6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO17Q96EF6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO17Q96EF6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO17Q96EF6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO17Q96EF6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO17Q96EF6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO17Q96EF6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO17Q96EF6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO17Q96EF6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO17Q96EF6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO17Q96EF6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO17Q96EF6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO17Q96EF6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO17Q96EF6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO17Q96EF6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO17Q96EF6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO17Q96EF6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO17Q96EF6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO17Q96EF6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO17Q96EF6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO17Q96EF6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO17Q96EF6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO17Q96EF6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO17Q96EF6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO17Q96EF6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO17Q96EF6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO17Q96EF6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO17Q96EF6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO17Q96EF6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO17Q96EF6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO17Q96EF6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO17Q96EF6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO17Q96EF6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO17Q96EF6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO17Q96EF6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO17Q96EF6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO17Q96EF6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO17Q96EF6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO17Q96EF6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO17Q96EF6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO17Q96EF6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO17Q96EF6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO17Q96EF6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO17Q96EF6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO17Q96EF6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO17Q96EF6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO17Q96EF6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FBXO17Q96EF6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms