Protein–RNA interactions for Protein: Q96EE3

SEH1L, Nucleoporin SEH1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1LQ96EE3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEH1LQ96EE3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEH1LQ96EE3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEH1LQ96EE3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEH1LQ96EE3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEH1LQ96EE3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEH1LQ96EE3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEH1LQ96EE3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEH1LQ96EE3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEH1LQ96EE3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEH1LQ96EE3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEH1LQ96EE3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SEH1LQ96EE3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEH1LQ96EE3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEH1LQ96EE3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEH1LQ96EE3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SEH1LQ96EE3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEH1LQ96EE3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEH1LQ96EE3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEH1LQ96EE3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEH1LQ96EE3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEH1LQ96EE3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEH1LQ96EE3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEH1LQ96EE3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEH1LQ96EE3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEH1LQ96EE3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEH1LQ96EE3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEH1LQ96EE3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEH1LQ96EE3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEH1LQ96EE3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEH1LQ96EE3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEH1LQ96EE3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEH1LQ96EE3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEH1LQ96EE3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEH1LQ96EE3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEH1LQ96EE3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEH1LQ96EE3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEH1LQ96EE3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEH1LQ96EE3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEH1LQ96EE3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEH1LQ96EE3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEH1LQ96EE3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEH1LQ96EE3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEH1LQ96EE3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEH1LQ96EE3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEH1LQ96EE3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEH1LQ96EE3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEH1LQ96EE3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEH1LQ96EE3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SEH1LQ96EE3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEH1LQ96EE3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEH1LQ96EE3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEH1LQ96EE3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEH1LQ96EE3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEH1LQ96EE3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEH1LQ96EE3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEH1LQ96EE3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEH1LQ96EE3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEH1LQ96EE3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEH1LQ96EE3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEH1LQ96EE3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEH1LQ96EE3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEH1LQ96EE3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEH1LQ96EE3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEH1LQ96EE3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEH1LQ96EE3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEH1LQ96EE3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEH1LQ96EE3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEH1LQ96EE3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEH1LQ96EE3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEH1LQ96EE3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEH1LQ96EE3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEH1LQ96EE3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEH1LQ96EE3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEH1LQ96EE3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEH1LQ96EE3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEH1LQ96EE3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEH1LQ96EE3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SEH1LQ96EE3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEH1LQ96EE3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEH1LQ96EE3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEH1LQ96EE3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEH1LQ96EE3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEH1LQ96EE3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEH1LQ96EE3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SEH1LQ96EE3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SEH1LQ96EE3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEH1LQ96EE3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEH1LQ96EE3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEH1LQ96EE3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEH1LQ96EE3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEH1LQ96EE3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SEH1LQ96EE3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEH1LQ96EE3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEH1LQ96EE3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEH1LQ96EE3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEH1LQ96EE3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEH1LQ96EE3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEH1LQ96EE3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEH1LQ96EE3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms