Protein–RNA interactions for Protein: Q96BI3

APH1A, Gamma-secretase subunit APH-1A, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1AQ96BI3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APH1AQ96BI3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APH1AQ96BI3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APH1AQ96BI3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APH1AQ96BI3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23■■□□□ 1.27
APH1AQ96BI3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23■■□□□ 1.27
APH1AQ96BI3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APH1AQ96BI3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APH1AQ96BI3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APH1AQ96BI3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APH1AQ96BI3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APH1AQ96BI3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APH1AQ96BI3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APH1AQ96BI3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APH1AQ96BI3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APH1AQ96BI3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APH1AQ96BI3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APH1AQ96BI3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APH1AQ96BI3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APH1AQ96BI3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APH1AQ96BI3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APH1AQ96BI3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APH1AQ96BI3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APH1AQ96BI3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APH1AQ96BI3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APH1AQ96BI3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APH1AQ96BI3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APH1AQ96BI3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APH1AQ96BI3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
APH1AQ96BI3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APH1AQ96BI3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APH1AQ96BI3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APH1AQ96BI3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APH1AQ96BI3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APH1AQ96BI3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
APH1AQ96BI3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APH1AQ96BI3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APH1AQ96BI3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APH1AQ96BI3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APH1AQ96BI3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APH1AQ96BI3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APH1AQ96BI3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
APH1AQ96BI3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APH1AQ96BI3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APH1AQ96BI3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APH1AQ96BI3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APH1AQ96BI3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
APH1AQ96BI3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APH1AQ96BI3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APH1AQ96BI3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APH1AQ96BI3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APH1AQ96BI3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APH1AQ96BI3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APH1AQ96BI3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APH1AQ96BI3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APH1AQ96BI3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APH1AQ96BI3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APH1AQ96BI3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APH1AQ96BI3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APH1AQ96BI3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APH1AQ96BI3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APH1AQ96BI3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APH1AQ96BI3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APH1AQ96BI3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APH1AQ96BI3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APH1AQ96BI3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APH1AQ96BI3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APH1AQ96BI3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APH1AQ96BI3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APH1AQ96BI3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
APH1AQ96BI3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APH1AQ96BI3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APH1AQ96BI3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APH1AQ96BI3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APH1AQ96BI3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APH1AQ96BI3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APH1AQ96BI3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
APH1AQ96BI3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APH1AQ96BI3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APH1AQ96BI3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APH1AQ96BI3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APH1AQ96BI3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APH1AQ96BI3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APH1AQ96BI3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
APH1AQ96BI3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
APH1AQ96BI3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
APH1AQ96BI3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APH1AQ96BI3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APH1AQ96BI3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APH1AQ96BI3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APH1AQ96BI3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APH1AQ96BI3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APH1AQ96BI3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APH1AQ96BI3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APH1AQ96BI3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APH1AQ96BI3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
APH1AQ96BI3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
APH1AQ96BI3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APH1AQ96BI3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APH1AQ96BI3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms