Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY4

TTC28, Tetratricopeptide repeat protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 2,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28Q96AY4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TTC28Q96AY4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TTC28Q96AY4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TTC28Q96AY4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TTC28Q96AY4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TTC28Q96AY4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TTC28Q96AY4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TTC28Q96AY4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TTC28Q96AY4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TTC28Q96AY4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTC28Q96AY4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTC28Q96AY4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTC28Q96AY4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTC28Q96AY4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTC28Q96AY4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTC28Q96AY4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTC28Q96AY4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTC28Q96AY4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTC28Q96AY4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTC28Q96AY4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTC28Q96AY4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTC28Q96AY4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TTC28Q96AY4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTC28Q96AY4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTC28Q96AY4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTC28Q96AY4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTC28Q96AY4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTC28Q96AY4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTC28Q96AY4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTC28Q96AY4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTC28Q96AY4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTC28Q96AY4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC28Q96AY4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC28Q96AY4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC28Q96AY4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC28Q96AY4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTC28Q96AY4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTC28Q96AY4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTC28Q96AY4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC28Q96AY4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC28Q96AY4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC28Q96AY4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC28Q96AY4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTC28Q96AY4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTC28Q96AY4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTC28Q96AY4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTC28Q96AY4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC28Q96AY4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC28Q96AY4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC28Q96AY4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTC28Q96AY4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTC28Q96AY4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTC28Q96AY4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TTC28Q96AY4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TTC28Q96AY4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTC28Q96AY4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTC28Q96AY4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTC28Q96AY4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTC28Q96AY4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTC28Q96AY4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTC28Q96AY4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TTC28Q96AY4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTC28Q96AY4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTC28Q96AY4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTC28Q96AY4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTC28Q96AY4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTC28Q96AY4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTC28Q96AY4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTC28Q96AY4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTC28Q96AY4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTC28Q96AY4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTC28Q96AY4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTC28Q96AY4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTC28Q96AY4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTC28Q96AY4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTC28Q96AY4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC28Q96AY4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC28Q96AY4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC28Q96AY4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTC28Q96AY4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTC28Q96AY4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TTC28Q96AY4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTC28Q96AY4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTC28Q96AY4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTC28Q96AY4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTC28Q96AY4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC28Q96AY4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC28Q96AY4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC28Q96AY4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC28Q96AY4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC28Q96AY4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC28Q96AY4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC28Q96AY4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC28Q96AY4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC28Q96AY4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC28Q96AY4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC28Q96AY4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC28Q96AY4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTC28Q96AY4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTC28Q96AY4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms