Protein–RNA interactions for Protein: Q96AW1

VOPP1, Vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VOPP1Q96AW1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VOPP1Q96AW1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VOPP1Q96AW1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VOPP1Q96AW1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VOPP1Q96AW1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VOPP1Q96AW1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VOPP1Q96AW1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VOPP1Q96AW1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VOPP1Q96AW1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VOPP1Q96AW1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
VOPP1Q96AW1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VOPP1Q96AW1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VOPP1Q96AW1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VOPP1Q96AW1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
VOPP1Q96AW1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VOPP1Q96AW1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VOPP1Q96AW1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VOPP1Q96AW1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VOPP1Q96AW1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VOPP1Q96AW1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
VOPP1Q96AW1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VOPP1Q96AW1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
VOPP1Q96AW1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
VOPP1Q96AW1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VOPP1Q96AW1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VOPP1Q96AW1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VOPP1Q96AW1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VOPP1Q96AW1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VOPP1Q96AW1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VOPP1Q96AW1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VOPP1Q96AW1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VOPP1Q96AW1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VOPP1Q96AW1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
VOPP1Q96AW1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
VOPP1Q96AW1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
VOPP1Q96AW1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VOPP1Q96AW1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VOPP1Q96AW1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
VOPP1Q96AW1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VOPP1Q96AW1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VOPP1Q96AW1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VOPP1Q96AW1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VOPP1Q96AW1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VOPP1Q96AW1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VOPP1Q96AW1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VOPP1Q96AW1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VOPP1Q96AW1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
VOPP1Q96AW1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VOPP1Q96AW1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VOPP1Q96AW1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VOPP1Q96AW1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
VOPP1Q96AW1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VOPP1Q96AW1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VOPP1Q96AW1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VOPP1Q96AW1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VOPP1Q96AW1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VOPP1Q96AW1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VOPP1Q96AW1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VOPP1Q96AW1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VOPP1Q96AW1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VOPP1Q96AW1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
VOPP1Q96AW1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VOPP1Q96AW1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
VOPP1Q96AW1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VOPP1Q96AW1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VOPP1Q96AW1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VOPP1Q96AW1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
VOPP1Q96AW1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VOPP1Q96AW1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VOPP1Q96AW1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VOPP1Q96AW1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
VOPP1Q96AW1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
VOPP1Q96AW1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
VOPP1Q96AW1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
VOPP1Q96AW1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
VOPP1Q96AW1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
VOPP1Q96AW1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
VOPP1Q96AW1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
VOPP1Q96AW1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
VOPP1Q96AW1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VOPP1Q96AW1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VOPP1Q96AW1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VOPP1Q96AW1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VOPP1Q96AW1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VOPP1Q96AW1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VOPP1Q96AW1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VOPP1Q96AW1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VOPP1Q96AW1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VOPP1Q96AW1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VOPP1Q96AW1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VOPP1Q96AW1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VOPP1Q96AW1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VOPP1Q96AW1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VOPP1Q96AW1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VOPP1Q96AW1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VOPP1Q96AW1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VOPP1Q96AW1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VOPP1Q96AW1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VOPP1Q96AW1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VOPP1Q96AW1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms