Protein–RNA interactions for Protein: Q96AN5

TMEM143, Transmembrane protein 143, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM143Q96AN5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMEM143Q96AN5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMEM143Q96AN5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMEM143Q96AN5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TMEM143Q96AN5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMEM143Q96AN5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMEM143Q96AN5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMEM143Q96AN5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMEM143Q96AN5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMEM143Q96AN5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMEM143Q96AN5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TMEM143Q96AN5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TMEM143Q96AN5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TMEM143Q96AN5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMEM143Q96AN5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMEM143Q96AN5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TMEM143Q96AN5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMEM143Q96AN5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMEM143Q96AN5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMEM143Q96AN5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMEM143Q96AN5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMEM143Q96AN5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TMEM143Q96AN5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMEM143Q96AN5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMEM143Q96AN5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMEM143Q96AN5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMEM143Q96AN5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMEM143Q96AN5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMEM143Q96AN5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMEM143Q96AN5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMEM143Q96AN5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMEM143Q96AN5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMEM143Q96AN5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMEM143Q96AN5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMEM143Q96AN5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TMEM143Q96AN5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TMEM143Q96AN5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMEM143Q96AN5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMEM143Q96AN5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TMEM143Q96AN5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMEM143Q96AN5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMEM143Q96AN5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMEM143Q96AN5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMEM143Q96AN5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMEM143Q96AN5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMEM143Q96AN5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
TMEM143Q96AN5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMEM143Q96AN5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMEM143Q96AN5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMEM143Q96AN5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TMEM143Q96AN5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMEM143Q96AN5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMEM143Q96AN5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMEM143Q96AN5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMEM143Q96AN5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMEM143Q96AN5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMEM143Q96AN5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMEM143Q96AN5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMEM143Q96AN5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMEM143Q96AN5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMEM143Q96AN5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMEM143Q96AN5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMEM143Q96AN5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TMEM143Q96AN5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TMEM143Q96AN5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TMEM143Q96AN5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TMEM143Q96AN5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TMEM143Q96AN5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TMEM143Q96AN5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TMEM143Q96AN5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TMEM143Q96AN5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TMEM143Q96AN5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMEM143Q96AN5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMEM143Q96AN5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMEM143Q96AN5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMEM143Q96AN5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMEM143Q96AN5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMEM143Q96AN5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMEM143Q96AN5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMEM143Q96AN5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMEM143Q96AN5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TMEM143Q96AN5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TMEM143Q96AN5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMEM143Q96AN5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMEM143Q96AN5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMEM143Q96AN5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMEM143Q96AN5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMEM143Q96AN5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMEM143Q96AN5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMEM143Q96AN5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMEM143Q96AN5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMEM143Q96AN5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMEM143Q96AN5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMEM143Q96AN5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMEM143Q96AN5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TMEM143Q96AN5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMEM143Q96AN5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMEM143Q96AN5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMEM143Q96AN5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMEM143Q96AN5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms