Protein–RNA interactions for Protein: Q96A44

SPSB4, SPRY domain-containing SOCS box protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB4Q96A44 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPSB4Q96A44 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPSB4Q96A44 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPSB4Q96A44 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPSB4Q96A44 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPSB4Q96A44 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPSB4Q96A44 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPSB4Q96A44 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPSB4Q96A44 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPSB4Q96A44 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPSB4Q96A44 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPSB4Q96A44 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPSB4Q96A44 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPSB4Q96A44 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPSB4Q96A44 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPSB4Q96A44 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPSB4Q96A44 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPSB4Q96A44 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPSB4Q96A44 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPSB4Q96A44 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPSB4Q96A44 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPSB4Q96A44 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPSB4Q96A44 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SPSB4Q96A44 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPSB4Q96A44 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPSB4Q96A44 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPSB4Q96A44 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPSB4Q96A44 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPSB4Q96A44 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPSB4Q96A44 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPSB4Q96A44 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPSB4Q96A44 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPSB4Q96A44 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPSB4Q96A44 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPSB4Q96A44 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPSB4Q96A44 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPSB4Q96A44 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPSB4Q96A44 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPSB4Q96A44 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPSB4Q96A44 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPSB4Q96A44 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPSB4Q96A44 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPSB4Q96A44 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPSB4Q96A44 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPSB4Q96A44 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPSB4Q96A44 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SPSB4Q96A44 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SPSB4Q96A44 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPSB4Q96A44 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPSB4Q96A44 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SPSB4Q96A44 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPSB4Q96A44 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SPSB4Q96A44 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPSB4Q96A44 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPSB4Q96A44 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPSB4Q96A44 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPSB4Q96A44 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPSB4Q96A44 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPSB4Q96A44 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPSB4Q96A44 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPSB4Q96A44 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPSB4Q96A44 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPSB4Q96A44 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPSB4Q96A44 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPSB4Q96A44 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPSB4Q96A44 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPSB4Q96A44 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPSB4Q96A44 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPSB4Q96A44 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPSB4Q96A44 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPSB4Q96A44 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPSB4Q96A44 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPSB4Q96A44 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPSB4Q96A44 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPSB4Q96A44 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPSB4Q96A44 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPSB4Q96A44 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPSB4Q96A44 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPSB4Q96A44 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPSB4Q96A44 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPSB4Q96A44 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPSB4Q96A44 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPSB4Q96A44 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPSB4Q96A44 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPSB4Q96A44 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPSB4Q96A44 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPSB4Q96A44 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPSB4Q96A44 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPSB4Q96A44 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPSB4Q96A44 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPSB4Q96A44 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPSB4Q96A44 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPSB4Q96A44 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPSB4Q96A44 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPSB4Q96A44 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPSB4Q96A44 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPSB4Q96A44 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPSB4Q96A44 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPSB4Q96A44 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPSB4Q96A44 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms