Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NKD2Q969F2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NKD2Q969F2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NKD2Q969F2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NKD2Q969F2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NKD2Q969F2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NKD2Q969F2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NKD2Q969F2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NKD2Q969F2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NKD2Q969F2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NKD2Q969F2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NKD2Q969F2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NKD2Q969F2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NKD2Q969F2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NKD2Q969F2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NKD2Q969F2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NKD2Q969F2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NKD2Q969F2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NKD2Q969F2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NKD2Q969F2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NKD2Q969F2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NKD2Q969F2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NKD2Q969F2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NKD2Q969F2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NKD2Q969F2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NKD2Q969F2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NKD2Q969F2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NKD2Q969F2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NKD2Q969F2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NKD2Q969F2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NKD2Q969F2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NKD2Q969F2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NKD2Q969F2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NKD2Q969F2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NKD2Q969F2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NKD2Q969F2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NKD2Q969F2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NKD2Q969F2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NKD2Q969F2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NKD2Q969F2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NKD2Q969F2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NKD2Q969F2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NKD2Q969F2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NKD2Q969F2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NKD2Q969F2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NKD2Q969F2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NKD2Q969F2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NKD2Q969F2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NKD2Q969F2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NKD2Q969F2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NKD2Q969F2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NKD2Q969F2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NKD2Q969F2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NKD2Q969F2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NKD2Q969F2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NKD2Q969F2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NKD2Q969F2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NKD2Q969F2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NKD2Q969F2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NKD2Q969F2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NKD2Q969F2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NKD2Q969F2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NKD2Q969F2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NKD2Q969F2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NKD2Q969F2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NKD2Q969F2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NKD2Q969F2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NKD2Q969F2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NKD2Q969F2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NKD2Q969F2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NKD2Q969F2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NKD2Q969F2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NKD2Q969F2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NKD2Q969F2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NKD2Q969F2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NKD2Q969F2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NKD2Q969F2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NKD2Q969F2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NKD2Q969F2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NKD2Q969F2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NKD2Q969F2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NKD2Q969F2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NKD2Q969F2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NKD2Q969F2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NKD2Q969F2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NKD2Q969F2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NKD2Q969F2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NKD2Q969F2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NKD2Q969F2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NKD2Q969F2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NKD2Q969F2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NKD2Q969F2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NKD2Q969F2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NKD2Q969F2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NKD2Q969F2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NKD2Q969F2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NKD2Q969F2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NKD2Q969F2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NKD2Q969F2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NKD2Q969F2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms