Protein–RNA interactions for Protein: Q93096

PTP4A1, Protein tyrosine phosphatase type IVA 1, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A1Q93096 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTP4A1Q93096 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTP4A1Q93096 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTP4A1Q93096 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTP4A1Q93096 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTP4A1Q93096 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTP4A1Q93096 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTP4A1Q93096 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTP4A1Q93096 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTP4A1Q93096 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTP4A1Q93096 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTP4A1Q93096 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTP4A1Q93096 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTP4A1Q93096 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTP4A1Q93096 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTP4A1Q93096 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTP4A1Q93096 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTP4A1Q93096 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTP4A1Q93096 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTP4A1Q93096 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTP4A1Q93096 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTP4A1Q93096 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTP4A1Q93096 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTP4A1Q93096 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTP4A1Q93096 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTP4A1Q93096 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTP4A1Q93096 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTP4A1Q93096 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTP4A1Q93096 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTP4A1Q93096 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTP4A1Q93096 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTP4A1Q93096 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTP4A1Q93096 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTP4A1Q93096 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTP4A1Q93096 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTP4A1Q93096 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTP4A1Q93096 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTP4A1Q93096 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTP4A1Q93096 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTP4A1Q93096 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTP4A1Q93096 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTP4A1Q93096 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTP4A1Q93096 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTP4A1Q93096 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTP4A1Q93096 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTP4A1Q93096 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTP4A1Q93096 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTP4A1Q93096 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTP4A1Q93096 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTP4A1Q93096 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTP4A1Q93096 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTP4A1Q93096 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTP4A1Q93096 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTP4A1Q93096 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTP4A1Q93096 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTP4A1Q93096 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTP4A1Q93096 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTP4A1Q93096 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTP4A1Q93096 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTP4A1Q93096 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTP4A1Q93096 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTP4A1Q93096 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTP4A1Q93096 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTP4A1Q93096 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTP4A1Q93096 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTP4A1Q93096 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTP4A1Q93096 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTP4A1Q93096 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTP4A1Q93096 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTP4A1Q93096 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTP4A1Q93096 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTP4A1Q93096 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTP4A1Q93096 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTP4A1Q93096 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTP4A1Q93096 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTP4A1Q93096 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTP4A1Q93096 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTP4A1Q93096 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTP4A1Q93096 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTP4A1Q93096 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTP4A1Q93096 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTP4A1Q93096 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTP4A1Q93096 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTP4A1Q93096 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTP4A1Q93096 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTP4A1Q93096 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTP4A1Q93096 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTP4A1Q93096 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTP4A1Q93096 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTP4A1Q93096 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTP4A1Q93096 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTP4A1Q93096 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTP4A1Q93096 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTP4A1Q93096 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTP4A1Q93096 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTP4A1Q93096 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTP4A1Q93096 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTP4A1Q93096 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTP4A1Q93096 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTP4A1Q93096 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms