Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP2A3Q93084 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP2A3Q93084 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP2A3Q93084 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP2A3Q93084 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP2A3Q93084 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP2A3Q93084 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP2A3Q93084 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP2A3Q93084 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP2A3Q93084 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP2A3Q93084 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATP2A3Q93084 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP2A3Q93084 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP2A3Q93084 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP2A3Q93084 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP2A3Q93084 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2A3Q93084 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2A3Q93084 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2A3Q93084 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2A3Q93084 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2A3Q93084 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP2A3Q93084 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP2A3Q93084 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP2A3Q93084 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP2A3Q93084 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP2A3Q93084 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP2A3Q93084 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP2A3Q93084 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP2A3Q93084 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATP2A3Q93084 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP2A3Q93084 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP2A3Q93084 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP2A3Q93084 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2A3Q93084 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2A3Q93084 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2A3Q93084 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP2A3Q93084 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP2A3Q93084 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP2A3Q93084 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP2A3Q93084 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP2A3Q93084 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP2A3Q93084 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP2A3Q93084 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP2A3Q93084 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP2A3Q93084 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP2A3Q93084 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP2A3Q93084 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP2A3Q93084 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP2A3Q93084 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP2A3Q93084 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP2A3Q93084 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP2A3Q93084 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2A3Q93084 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2A3Q93084 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2A3Q93084 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP2A3Q93084 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP2A3Q93084 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP2A3Q93084 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP2A3Q93084 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP2A3Q93084 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP2A3Q93084 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP2A3Q93084 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP2A3Q93084 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP2A3Q93084 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP2A3Q93084 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP2A3Q93084 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP2A3Q93084 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP2A3Q93084 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP2A3Q93084 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP2A3Q93084 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP2A3Q93084 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP2A3Q93084 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP2A3Q93084 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP2A3Q93084 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP2A3Q93084 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP2A3Q93084 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP2A3Q93084 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP2A3Q93084 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP2A3Q93084 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP2A3Q93084 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP2A3Q93084 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP2A3Q93084 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP2A3Q93084 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP2A3Q93084 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP2A3Q93084 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP2A3Q93084 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP2A3Q93084 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP2A3Q93084 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP2A3Q93084 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP2A3Q93084 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP2A3Q93084 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP2A3Q93084 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP2A3Q93084 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATP2A3Q93084 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP2A3Q93084 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP2A3Q93084 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP2A3Q93084 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP2A3Q93084 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP2A3Q93084 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP2A3Q93084 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms