Protein–RNA interactions for Protein: Q92859

NEO1, Neogenin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEO1Q92859 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
NEO1Q92859 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
NEO1Q92859 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
NEO1Q92859 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
NEO1Q92859 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC40.38■■■■■ 4.05
NEO1Q92859 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
NEO1Q92859 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
NEO1Q92859 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
NEO1Q92859 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
NEO1Q92859 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
NEO1Q92859 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
NEO1Q92859 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC40.36■■■■■ 4.05
NEO1Q92859 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
NEO1Q92859 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
NEO1Q92859 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
NEO1Q92859 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
NEO1Q92859 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC40.35■■■■■ 4.05
NEO1Q92859 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
NEO1Q92859 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
NEO1Q92859 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
NEO1Q92859 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
NEO1Q92859 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.04
NEO1Q92859 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
NEO1Q92859 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
NEO1Q92859 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
NEO1Q92859 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
NEO1Q92859 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.29■■■■■ 4.04
NEO1Q92859 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
NEO1Q92859 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC40.29■■■■■ 4.04
NEO1Q92859 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
NEO1Q92859 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.27■■■■■ 4.04
NEO1Q92859 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC40.26■■■■■ 4.04
NEO1Q92859 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
NEO1Q92859 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC40.26■■■■■ 4.03
NEO1Q92859 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
NEO1Q92859 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
NEO1Q92859 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC40.2■■■■■ 4.03
NEO1Q92859 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.03
NEO1Q92859 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
NEO1Q92859 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
NEO1Q92859 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
NEO1Q92859 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC40.17■■■■■ 4.02
NEO1Q92859 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
NEO1Q92859 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
NEO1Q92859 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
NEO1Q92859 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
NEO1Q92859 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.02
NEO1Q92859 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
NEO1Q92859 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
NEO1Q92859 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
NEO1Q92859 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
NEO1Q92859 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
NEO1Q92859 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
NEO1Q92859 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
NEO1Q92859 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
NEO1Q92859 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
NEO1Q92859 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
NEO1Q92859 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC40.06■■■■■ 4
NEO1Q92859 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
NEO1Q92859 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
NEO1Q92859 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
NEO1Q92859 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
NEO1Q92859 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
NEO1Q92859 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC40.05■■■■■ 4
NEO1Q92859 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
NEO1Q92859 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
NEO1Q92859 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
NEO1Q92859 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC40.02■■■■■ 4
NEO1Q92859 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
NEO1Q92859 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
NEO1Q92859 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
NEO1Q92859 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
NEO1Q92859 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
NEO1Q92859 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
NEO1Q92859 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
NEO1Q92859 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
NEO1Q92859 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC40■■■■□ 3.99
NEO1Q92859 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
NEO1Q92859 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
NEO1Q92859 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
NEO1Q92859 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
NEO1Q92859 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
NEO1Q92859 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
NEO1Q92859 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC39.97■■■■□ 3.99
NEO1Q92859 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
NEO1Q92859 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
NEO1Q92859 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
NEO1Q92859 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
NEO1Q92859 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
NEO1Q92859 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.94■■■■□ 3.98
NEO1Q92859 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
NEO1Q92859 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
NEO1Q92859 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
NEO1Q92859 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
NEO1Q92859 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
NEO1Q92859 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
NEO1Q92859 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
NEO1Q92859 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
NEO1Q92859 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
NEO1Q92859 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms