Protein–RNA interactions for Protein: Q92581

SLC9A6, Sodium/hydrogen exchanger 6, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A6Q92581 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC9A6Q92581 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC9A6Q92581 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC9A6Q92581 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC9A6Q92581 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC9A6Q92581 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC9A6Q92581 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC9A6Q92581 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC9A6Q92581 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC9A6Q92581 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC9A6Q92581 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC9A6Q92581 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC9A6Q92581 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC9A6Q92581 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC9A6Q92581 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC9A6Q92581 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC9A6Q92581 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC9A6Q92581 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC9A6Q92581 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC9A6Q92581 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC9A6Q92581 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC9A6Q92581 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC9A6Q92581 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC9A6Q92581 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC9A6Q92581 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC9A6Q92581 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC9A6Q92581 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC9A6Q92581 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC9A6Q92581 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC9A6Q92581 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC9A6Q92581 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC9A6Q92581 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC9A6Q92581 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC9A6Q92581 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC9A6Q92581 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC9A6Q92581 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC9A6Q92581 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC9A6Q92581 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC9A6Q92581 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC9A6Q92581 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC9A6Q92581 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC9A6Q92581 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC9A6Q92581 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC9A6Q92581 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC9A6Q92581 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC9A6Q92581 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC9A6Q92581 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC9A6Q92581 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC9A6Q92581 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC9A6Q92581 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC9A6Q92581 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC9A6Q92581 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC9A6Q92581 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC9A6Q92581 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC9A6Q92581 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC9A6Q92581 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC9A6Q92581 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC9A6Q92581 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC9A6Q92581 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC9A6Q92581 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC9A6Q92581 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC9A6Q92581 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC9A6Q92581 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC9A6Q92581 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC9A6Q92581 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC9A6Q92581 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC9A6Q92581 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC9A6Q92581 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC9A6Q92581 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC9A6Q92581 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC9A6Q92581 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC9A6Q92581 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC9A6Q92581 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC9A6Q92581 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC9A6Q92581 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC9A6Q92581 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC9A6Q92581 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC9A6Q92581 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC9A6Q92581 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC9A6Q92581 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC9A6Q92581 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC9A6Q92581 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC9A6Q92581 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC9A6Q92581 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC9A6Q92581 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC9A6Q92581 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC9A6Q92581 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A6Q92581 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A6Q92581 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A6Q92581 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A6Q92581 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A6Q92581 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC9A6Q92581 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC9A6Q92581 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC9A6Q92581 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC9A6Q92581 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC9A6Q92581 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC9A6Q92581 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC9A6Q92581 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC9A6Q92581 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms