Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN0

ATG4A, Cysteine protease ATG4A, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AQ8WYN0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATG4AQ8WYN0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATG4AQ8WYN0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATG4AQ8WYN0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATG4AQ8WYN0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ATG4AQ8WYN0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATG4AQ8WYN0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATG4AQ8WYN0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATG4AQ8WYN0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATG4AQ8WYN0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATG4AQ8WYN0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATG4AQ8WYN0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATG4AQ8WYN0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATG4AQ8WYN0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATG4AQ8WYN0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATG4AQ8WYN0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATG4AQ8WYN0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATG4AQ8WYN0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATG4AQ8WYN0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATG4AQ8WYN0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATG4AQ8WYN0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATG4AQ8WYN0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATG4AQ8WYN0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATG4AQ8WYN0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATG4AQ8WYN0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATG4AQ8WYN0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ATG4AQ8WYN0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATG4AQ8WYN0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATG4AQ8WYN0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATG4AQ8WYN0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATG4AQ8WYN0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATG4AQ8WYN0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATG4AQ8WYN0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATG4AQ8WYN0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATG4AQ8WYN0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATG4AQ8WYN0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATG4AQ8WYN0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATG4AQ8WYN0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATG4AQ8WYN0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATG4AQ8WYN0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATG4AQ8WYN0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATG4AQ8WYN0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATG4AQ8WYN0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATG4AQ8WYN0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATG4AQ8WYN0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATG4AQ8WYN0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATG4AQ8WYN0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATG4AQ8WYN0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATG4AQ8WYN0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATG4AQ8WYN0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATG4AQ8WYN0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATG4AQ8WYN0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
ATG4AQ8WYN0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATG4AQ8WYN0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATG4AQ8WYN0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATG4AQ8WYN0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATG4AQ8WYN0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATG4AQ8WYN0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATG4AQ8WYN0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATG4AQ8WYN0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATG4AQ8WYN0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATG4AQ8WYN0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATG4AQ8WYN0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATG4AQ8WYN0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATG4AQ8WYN0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG4AQ8WYN0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATG4AQ8WYN0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATG4AQ8WYN0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ATG4AQ8WYN0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATG4AQ8WYN0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATG4AQ8WYN0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATG4AQ8WYN0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATG4AQ8WYN0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATG4AQ8WYN0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATG4AQ8WYN0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATG4AQ8WYN0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATG4AQ8WYN0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATG4AQ8WYN0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATG4AQ8WYN0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATG4AQ8WYN0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATG4AQ8WYN0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATG4AQ8WYN0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ATG4AQ8WYN0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATG4AQ8WYN0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATG4AQ8WYN0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATG4AQ8WYN0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATG4AQ8WYN0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATG4AQ8WYN0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATG4AQ8WYN0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATG4AQ8WYN0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATG4AQ8WYN0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATG4AQ8WYN0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATG4AQ8WYN0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATG4AQ8WYN0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATG4AQ8WYN0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATG4AQ8WYN0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATG4AQ8WYN0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATG4AQ8WYN0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATG4AQ8WYN0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ATG4AQ8WYN0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms